2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Команды, полезные для выполнения заданий
label %r # показывает номера остатков при каждом атоме из выделенного множества label off
Для построения ВСЕХ водородных связей, а не только связей между остовными атомами, надо выполнить сначала следующие команды:
set hbondsRasmol false @hbondsAngleMinimum = 90 #задает минимум угла водородной связи - см. ваше задание 2 в практ. 1 @hbondsDistanceMaximum = 3.5 #задает максимальное расстояние водородной связи.
Водородные связи находятся и изображаются как и раньше:
select <нужное множество> hbonds calculate hbonds 40 color hbonds green # если хотите чтобы водородные связи были зелеными
Могут пригодится такие предопределенные множества атомов
select charged # понятно select ligands # понятно select oxygen # все кислороды select nitrogen # все азоты select water # все молекулы воды select backbone # все атомы остова полипептидной цепи (без боковых цепей)