Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2014

Семестры Студенты Преподаватели

• 2024
• 2023
• 2022
• 2021
• 2020
• 2019
• 2018
• 2017

• ...

Практические занятия к курсу "Молекулярное Моделирование Биополимеров"

Новые варианты лекций вместе с исходной разметкой в LaTex можно посмотреть тут: http://vsb.fbb.msu.ru/rhodecode/mm_course_lectures

Правила сдачи зачёта

Связи с тем, что практикум предполагает использование суперкомпьютера и время доступа ограничено, то ожидается, что к этому моменту студенты будут знакомы с материалом. Для достижения этого результата необходим контроль за исполнением заданий. Итак:

• Если сумма баллов за практикумы менее 0.666 от максимальной, то студент получает дополнительнo на зачёте.

Жду рациональных предложений по улучшению курса.

Результаты практической работы

Результаты доступны в виде google таблицы. Из таблицы видно как оцениваются задания.

google sheet

1. Знакомство с Pymol

16 февраля 2018, А.В.Головин. [задания] [презентация]

2. Работа Pymol

2 марта 2018, А.В.Головин. [задания]

3. Хемоинформатика

16 марта 2018, А.В.Головин. [задания]

4. Ab initio вычисления орбиталей водорода

22 марта 2018, А.В.Головин. [задания]

5. Полуэмпирические и Ab initio вычисления молекулярных систем

23 марта 2018, А.В.Головин. [задания]

6. Вычисление ковалентных параметров для молекулярной механики

30 марта 2018, А.В.Головин. [задания]

7. Изучение работы методов контроля температуры в молекулярной динамике

6 апреля 2018, А.В.Головин. [задания]

8. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом

13 апреля 2018, А.В. Головин [задания]

9. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка

20 апреля 2018, А.В. Головин [задания]

10. Макромолекулярный докинг

27 апреля 2018, А.В. Головин [задания]

11. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS

4 мая 2018, А.В. Головин [задания]

12. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS

11 мая 2018, А.В. Головин [задания]