Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2015

Задание

Дан файл с множественным выравниванием в формате Clustal.

1) Вывести выравнивание в другой файл в формате fasta

2) Посчитать среднюю длину безделеционных блоков выравнивания (безделеционный блок - несколько идущих подряд столбцов выравнивания, которые не содержат делеций)

3) вывести на экран консенсусную последовательность для каждого безделеционного блока (консенсусная последовательность - для каждого столбца выравнивания выбирается самая частая буква)

Примеры множественных выравниваний в формате ClustAl (Берете файлы с расширением .clustalw)