Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2015
Задание
Дан файл с множественным выравниванием в формате Clustal.
1) Вывести выравнивание в другой файл в формате fasta
2) Посчитать среднюю длину безделеционных блоков выравнивания (безделеционный блок - несколько идущих подряд столбцов выравнивания, которые не содержат делеций)
3) вывести на экран консенсусную последовательность для каждого безделеционного блока (консенсусная последовательность - для каждого столбца выравнивания выбирается самая частая буква)
Примеры множественных выравниваний в формате ClustAl (Берете файлы с расширением .clustalw)