Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2015
1.Найдите гидрофобные кластеры в структуре какого-либо белка
Используйте CluD: http://mouse.belozersky.msu.ru/npidb/cgi-bin/hftri.pl
- Меняйте параметры: порог расстояния и порог размера кластера, чтобы получить лучше интерпретируемый результат.
- Опишите соответствие кластеров доменам и субдоменам белка, определяемым визуально или как-либо иначе.
2. Найдите гидрофобные кластеры на интерфейсе двух цепочек в структуре какого-либо белкового димера (или комплекса белка с ДНК)
Опишите результат.