Kodomo

User

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2017

Задание 11

Можно делать любой из вариантов.

Вариант 1

См. здесь

Вариант 2. Реконструкция эволюции доменной архитектуры

Цель проекта

Задача 1. Построить выравнивание представителей домена Pfam белков с разной доменной архитектурой

См. указания

  1. Выбрать домен. Описать доменные архитектуры белков, содержащих домен.
  2. Выбрать две архитектуры, включающие этот домен
  3. Выбрать таксон и два его подтаксона для сравнения
  4. Выбрать не менее, чем по 20 представителей каждой из архитектур; для каждого подтаксона должно быть не менее 10 представителей каждой архитектуры.
  5. Определить таксономию каждого представителя.
  6. Получить и, при необходимости, отредактировать совместное выравнивание всех отобранных последовательностей домена.

В отчете на сайте должно быть:

Задача 2. Построить филогенетическое дерево последовательностей ДОМЕНА (а не полноразмерных белков)

См. указания

В отчете на сайте должно быть: