Kodomo

User

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2017

Эволюция последовательностей


Расписание

Результаты Только для студентов и преподавателей

Записаться в очередь на проверку

Состояние очереди


Новости

15 февраля

Ведомость и запись в очередь на проверку созданы. См. ссылки выше.

Делайте задания в срок и записывайтесь в очередь. И будет вам счастье:)

ААл


Блок 1: Молекулярная филогения

1. Что такое филогенетическое дерево

8 февраля 2019, С.А.Спирин

[ задания ] [ презентация ]

2. Реконструкция филогении

15 февраля 2019, С.А.Спирин

[ задания ] [ презентация ]

3. Укоренение и бутстрэп

22 февраля 2019, С.А.Спирин

[ задания ] [ презентация ]

4. Коллоквиум по первому блоку

1 марта 2019

[ программа коллоквиума ]

Блок 2: Функциональные классы белков

5. Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.

15 марта 2019, А.Жарикова

[ задания ] [ презентация ]

6. Геномное окружение.

22 марта 2019, А.Жарикова

[ задания ] [ презентация ]

7. Трансмембранные белки.

29 марта 2019, А.Жарикова

[ задания ] [ презентация ]

8. Коллоквиум по второму блоку

5 апреля 2019

Вопросы к коллоквиуму

К 22 марта нужно уметь узнавать по химической формуле:

  • обычные нуклеотиды (аденин, гуанин, тимин, урацил, цитозин);
  • аминокислоты (20 канонических);
  • сахара, жирные кислоты, фосфолипиды (как классы соединений, т.е. без индивидуальных названий).

К 29 марта вы должны уметь узнавать по химической формуле следующие вещества и знать их полные названия (желательно знать, для чего они используются ферментами): АТФ, АДФ, АМФ, цАМФ, НАД/НАДН, НАДФ/НАДФН, ФАД, ФМН, хиноны/хинолы (класс соединений), КоА, биотин, тиаминдифосфат, гем (класс соединений).

Блок 3: Профили, сигналы и эволюционные домены

9. Позиционные весовые матрицы

12 апреля 2019, З.Червонцева

[ задания ] [ презентация ]

10. PSSM и PSI-Blast

19 апреля 2019, З.Червонцева

[ задания ] [ презентация ]

11. Домены. Pfam. HMM профиль.

26 апреля 2019, С.А.Спирин, З.Червонцева, А.В. Алексеевский

[ презентация: домены ] [ презентация: HMM профили ] [ задания ] [ скрипты ]

12. Коллоквиум по третьему блоку

17 мая 2019

Вопросы к коллоквиуму