Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2017
Эволюция последовательностей
Результаты Только для студентов и преподавателей
Записаться в очередь на проверку
Новости
15 февраля Ведомость и запись в очередь на проверку созданы. См. ссылки выше. Делайте задания в срок и записывайтесь в очередь. И будет вам счастье:) ААл
Блок 1: Молекулярная филогения
1. Что такое филогенетическое дерево
8 февраля 2019, С.А.Спирин
[ задания ] [ презентация ]
2. Реконструкция филогении
15 февраля 2019, С.А.Спирин
[ задания ] [ презентация ]
3. Укоренение и бутстрэп
22 февраля 2019, С.А.Спирин
[ задания ] [ презентация ]
4. Коллоквиум по первому блоку
1 марта 2019
Блок 2: Функциональные классы белков
5. Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.
15 марта 2019, А.Жарикова
[ задания ] [ презентация ]
6. Геномное окружение.
22 марта 2019, А.Жарикова
[ задания ] [ презентация ]
7. Трансмембранные белки.
29 марта 2019, А.Жарикова
[ задания ] [ презентация ]
8. Коллоквиум по второму блоку
5 апреля 2019
К 22 марта нужно уметь узнавать по химической формуле:
- обычные нуклеотиды (аденин, гуанин, тимин, урацил, цитозин);
- аминокислоты (20 канонических);
- сахара, жирные кислоты, фосфолипиды (как классы соединений, т.е. без индивидуальных названий).
К 29 марта вы должны уметь узнавать по химической формуле следующие вещества и знать их полные названия (желательно знать, для чего они используются ферментами): АТФ, АДФ, АМФ, цАМФ, НАД/НАДН, НАДФ/НАДФН, ФАД, ФМН, хиноны/хинолы (класс соединений), КоА, биотин, тиаминдифосфат, гем (класс соединений).
Блок 3: Профили, сигналы и эволюционные домены
9. Позиционные весовые матрицы
12 апреля 2019, З.Червонцева
[ задания ] [ презентация ]
10. PSSM и PSI-Blast
19 апреля 2019, З.Червонцева
[ задания ] [ презентация ]
11. Домены. Pfam. HMM профиль.
26 апреля 2019, С.А.Спирин, З.Червонцева, А.В. Алексеевский
[ презентация: домены ] [ презентация: HMM профили ] [ задания ] [ скрипты ]
12. Коллоквиум по третьему блоку
17 мая 2019