Kodomo

User

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2017

Молекулярное моделирование биополимеров

Новые варианты лекций вместе с исходной разметкой в LaTex (без) можно посмотреть тут.

Правила сдачи зачёта

Связи с тем, что практикум предполагает использование суперкомпьютера и время доступа ограничено, то ожидается, что к этому моменту студенты будут знакомы с материалом. Для достижения этого результата необходим контроль за исполнением заданий. Поэтому, если сумма баллов за практикумы менее 0.666 от максимальной, то студент получает дополнительнo на зачёте.

Жду рациональных предложений по улучшению курса.

Очередь проверки работ

https://forms.gle/ECau795Siymd6fjP6

Результаты практической работы

Результаты доступны в виде google таблицы. Из таблицы видно как оцениваются задания.

scores: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1p4r6gzYAz6HftYA5rCXm_HyBc-uj8QgAefWNj1b6uiM/edit?usp=sharing

1. Знакомство и работа с Pymol

19 февраля, А.В. Головин

[ задания ] [ презентация ]

3. Хемоинформатика

3 марта, А.В. Головин

[ задания ]

4. Ab initio вычисления орбиталей водорода

10 марта, А.В. Головин

[ задания ]

5. Ab initio вычисление молекулы водорода

17 марта, А.В. Головин

[ задания ]

6. Вычисление ковалентных параметров для молекулярной механики

24 марта, А.В. Головин

[ задания ]

7. Изучение работы методов контроля температуры в молекулярной динамике

2 апреля, А.В. Головин

[ задания ]

8. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом

9 апреля, А.В. Головин

[ задания ]

9. Молекулярный докинг

16 апреля, А.В. Головин [ задания ]

10. Макромолекулярный докинг

23 апреля, А.В. Головин

[ задания ]

11. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS

30 апреля, А.В. Головин

[ задания ]

12. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS

7 мая, А.В. Головин

[ задания ]

13. Консультация

14 мая, А.В. Головин