2024
2023
2022
2021
2020
2019
2017
2016
Практикум 1
Обязательные задания
1. Включите любой компьютер и войдите под своим пользовательским именем, которое вы сообщили на орг. сборе курса
Инструкция содержится в подсказках.
Если что-то не получается — зовите преподавателя!
2. Знакомство. Напишите из своей почты на kodomo письмо преподавателям
Адреса: aba@belozersky.msu.ru , sas@fbb.msu.ru , aozalevsky@fbb.msu.ru (пишите одно письмо сразу на все три адреса). См.также по ссылке "Преподаватели" на странице курса на kodomo (чтобы ссылка открылась, нужно залогиниться, используя те же пользовательское имя и пароль, что для входа в систему).
Нас интересует:
ваш опыт в программировании, если имеется таковой, и в целом — ваша компьютерная грамотность;
- уровень владения английским;
- всё, что ещё захотите сообщить о себе.
Субъективность самооценок приветствуется :).
- Ведомости с результатами проверок мы ведём в Google Docs. Для вашего доступа к ведомостям нужно иметь учетную запись в Google (то есть почту в gmail.com).
Сообщите ваш адрес в gmail.com, если он у вас есть. Тогда мы откроем Вам доступ к ведомости. Если учетной записи в google у вас нет, то заведите её и сообщите письмом.
Оформление письма.
- в поле "Subject" укажите вашу фамилию латинскими буквами с заглавной буквы;
не лишним будет приветствие :)
- и подпись: каким именем подписываетесь, так к вам, скорее всего, обратятся в ответном письме.
3. Подготовка к работе
На диске H: заведите директорию term1, в ней поддиректорию block1, в ней поддиректорию credits (для зачётных заданий). Создайте в директории block1 еще одну директорию pr1 (для всех промежуточных файлов по текущему практикуму, черновых версий отчетных файлов и т.п.)
Проверьте еще раз, что директории называются именно так (без опечаток; без заглавных букв; на английском языке). — Каждое из трёх обязательных заданий должно быть выполнено для получения зачета за первый блок.
Дополнительные задания не являются обязательными для получения зачета. Они — для удовлетворения вашего и нашего интереса. Впрочем, выполненные дополнительные задания проверяются и за них даются баллы в рейтинг.
Лучше выполнить хорошо одно (любое) дополнительное задание, чем все кое-как.
Оценивать будем скорее ход ваших рассуждений, чем точность ответа (к тому же иногда ответ неизвестен:) )
Дополнительные задания
Ответы на дополнительные задания присылайте письмом. (Потом система сдачи заданий изменится.)
4. Узнайте размер генома одной (любой) бактерии. Поисковики — в вашем распоряжении.
5. Поймайте одного студента-старшекурсника, узнайте, о чём его курсовая или дипломная работа и кратко опишите в письме суть этой работы.
Из лекции
6. Узнайте размер Y-хромосомы человека и размер митохондриального генома человека. (Размер измеряется в парах нуклеотидов.)
7. Сколько мутаций в Y-хромосоме ПРЯМОГО потомка Otzi по отцовской линии вы ожидали бы? По сравнению с последовательностью Y-хромосомы Otzi, конечно.
8. Тот же вопрос — про митохондриальный геном прямого потомка по материнской линии, по сравнению с митохондриальным геномом матери Otzi, конечно.
9. (см. слайд 21) Предложите сами схему эксперимента, позволяющего покрасить хромосомы целиком в разные цвета.
10. (слайд 26) Дан один нуклеотид из ДНК Otzi. Сколько прочтений (в среднем) содержат этот нуклеотид?
11. (слайд 29) Откуда могли взяться прочтения ДНК, не картирующиеся на референсный геном человека?
12. (слайд 29) Почему прочтения покрывают не весь референсный геном?
13. Докажите, что по митохондриальной ДНК все ныне живущие женщины являются прямыми потомками ОДНОЙ женщины (ее называют митохондриальной Евой)