Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2018
Практикум 11: Excel 1
Результаты выполнения упражнений должны быть представлены в одном Excel файле, одно упражнение — на одном листе.
Заведите веб-страницу для четвёртого блока (со ссылкой со страницы семестра) и на ней поставьте ссылку на этот файл.
Название листа должно совпадать с номером упражнения. Пример: 2b. Исходные данные могут лежать на дополнительных страницах с именами вида source-2b. Аккуратность страниц (наличие заголовков столбцов и строк, их выделение форматированием и др.) приветствуется и оценивается.
Если вы заметили что-то интересное в результатах обработки биологических данных, то можете написать о своем наблюдении на веб-странице. Это приветствуется и оценивается, но не является обязательным.
Задание 1. Выполните не менее чем по одному упражнению из каждого блока
Таким образом, для зачёта минимальное число выполненных упражнений — шесть. При выполнении нескольких заданий из одного блока балл монотонно (но не линейно!) повышается. Точнее, за k-ое по счёту задание из одного блока к суммарному баллу прибавляется оценка за задание, делённая на k.
Датой сдачи задания 1 является дата сообщения о готовности в очереди для проверки. Дедлайны — как обычно. Одна неделя до мягкого, две — до жесткого. См. в ведомости, лист block4, по пр.11 колонка Z (мягкий: 30/11/2018 23:59, жесткий: 07/12/2018 9:00).
Задание 2: Создайте плоскую таблицу с описаниями генов белков и РНК в геноме вашей бактерии
Задание 2 будет проверяться вместе с результатом последнего практикума (pr_14). См. подсказки.
Задание 2: составьте таблицу, в которой для каждой плазмиды указан род и вид организма-хозяина
Информацию о плазмидах следует скачать с сайта anonymous@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/genomes/GENOME_REPORTS/plasmids.txt по протоколу ftp; рекомендуется использовать FAR => Netbox
то же — в INSDC;
род организма-хозяина — первое слово в названии организма, если:
это слово начинается с заглавной буквы (если первый символ – кавычка, скобка или строчная буква, считаем, что ни род, ни вид для организма не определён, ставим прочерк "–");
это не слово "Candidatus" (если первое слово – "Candidatus", то родовым названием является второе слово, но "на тройку" в этом случае тоже можно поставить прочерк) .