2023
2022
2021
2020
2019
2017
2016
2015
Практикум 13. Мембранные белки.
Отчетом по практикуму является веб-страница, размещенная на вашем сайте.
Выберите мембранный белок с известной структурой. Я рекомендую воздержаться от поиска белков, чьи структуры уже размещены в базах данных. Попробуйте зайти с другого конца: подумайте о том, какой биологические объект вам интересен (это может быть органелла, бактерия, вирус или эукариотическая клетка); подумайте о том, какого рода белки, ассоицированные связанные с мембраной у такого объекта могут быть; поищите в гугле или пабмеде - существуют ли такие или подобные белки. После чего приступайте к выполнению задания. Если окажется, что для выбранного объекта не хватает данных для выполнения практикума, повторите процедуру выбора.
В вашем отчете вы должны представить информацию об объекте и его взаимоотношениям с мембраной.
Содержимое отчета
* Описание выбранного объекта. В идеале, с описанием причин, по которым лично вы его выбрали.
* Предсказание трансмембранных участков при помощи сервиса TMHMM. Опишите, результат предсказания. Сколько трансмембранных участков, есть ли внутриклеточные участки. Какие другие особенности вы наблюдаете?
* Визуализация расположения белка в мембране. Можно воспользоваться готовой, доступной в банках OPM, PDBTM, RCSB PDB или MemProtMD