2024
2023
2022
2021
2020
2019
2017
2016
Молекулярное моделирование биополимеров
Новые варианты лекций вместе с исходной разметкой в LaTex (без) можно посмотреть тут.
Правила сдачи зачёта
Связи с тем, что практикум предполагает использование суперкомпьютера и время доступа ограничено, то ожидается, что к этому моменту студенты будут знакомы с материалом. Для достижения этого результата необходим контроль за исполнением заданий. Поэтому, если сумма баллов за практикумы менее 0.666 от максимальной, то студент получает дополнительно на зачёте.
Жду рациональных предложений по улучшению курса.
Очередь проверки работ
https://forms.gle/ECau795Siymd6fjP6
Результаты практической работы
Результаты доступны в виде google таблицы. Из таблицы видно как оцениваются задания.
scores: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1p4r6gzYAz6HftYA5rCXm_HyBc-uj8QgAefWNj1b6uiM/edit?usp=sharing
1. Знакомство и работа с Pymol
18 февраля, А.В. Головин
[ задания ] [ презентация ]
3. Хемоинформатика
3 марта, А.В. Головин
[ задания ]
4. Ab initio вычисления орбиталей водорода
10 марта, А.В. Головин
[ задания ]
5. Ab initio вычисление молекулы водорода
17 марта, А.В. Головин
[ задания ]
6. Вычисление ковалентных параметров для молекулярной механики
24 марта, А.В. Головин
[ задания ]
7. Изучение работы методов контроля температуры в молекулярной динамике
2 апреля, А.В. Головин
[ задания ]
11. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
30 апреля, А.В. Головин
[ задания ]
12. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS
7 мая, А.В. Головин
[ задания ]
8. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
9 апреля, А.В. Головин
[ задания ]
9. Молекулярный докинг
16 апреля, А.В. Головин [ задания ]
10. Макромолекулярный докинг
23 апреля, А.В. Головин
[ задания ]
13. Консультация
14 мая, А.В. Головин