Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2019
Билет 19
- Какие вы знаете типы протеомов в Uniprot? Смысл этих типов?
- В файле seq.fasta находится последовательность белка. Вам нужно вырезать из этой последовательности участок, с 15 по 187 остатки включительно, и положить в файл smallseq.fasta. Напишите команду, которая выполнит эту операцию.
- Расшифруйте термин "гомологичный" в утверждении: "60-ый остаток миоглобина человека гомологичен 55-му остатку миоглобина рыбы"?
- Опишите разницу между оптимальным выравниванием и правильным (эволюционным) выравниванием.
- За счёт чего BLAST работает быстрее, чем оптимальное локальное выравнивание запроса со всеми последовательностями банка?