Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2019

Семестр 2. Структуры и последовательности белков

Расписание

Результаты Только для студентов и преподавателей

Записаться в очередь на проверку

Состояние очереди

Здесь вы можете задать вопрос преподавателям по курсу 2го семестра

Здесь можно увидеть ответы на вопросы

Объявления

30 мая

С 17:30 я в 207-й.

Одновременно будет 2й курс, там разберемся об очередности.

— ААл

Сегодня, 30 мая в 10:00 я в последний раз в этом учебном году на полчаса открою форму коллоквиума по 3-4 блокам биоинформатики (см. https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/2019/2/colloquium_bl3-4_variants ). Кто и в этот раз не справится, отправляется на осень.

С.А.С.

29 мая

Сегодня, 29 мая в 19 час устраиваю сбор в 207й по поводу задания практикума 13. Если 2й курс еще не освободит аудиторию (им назначено на 17 час), то придется немного подождать.

Ответы на вопросы, он-лайн проверка задания с комментариями и др.

Напоминаю, получить зачёт надо завтра. Если, конечно вам зачёт нужен :)

Завтра вечером готов устроить еще одну такую же встречу.

Если вы прочитали - сообщите всем.

ААл

13 мая

Коллеги! Вот что я придумал. В ведомости сделал страницу для работ студентов по любой теме семестра, выполненных по личной инициативе.

Внес в неё оценки за рукопись Данила Владимирова, Максима Кряквина и Ивана Маркова об S-белке корона вируса. Оценки идут в рейтинг семестра.

Соответственно, любой из вас, кто что-то делал просто из интереса (в рамках тем семестра) может попросить "любимого" преподавателя оценить его работу. Если такая работа делается в рамках будущей курсовой, то тоже можно, почему бы и нет? Ведь это ваша инициатива! Естественно, надо прислать отчёт о работе.

ААл

7 мая

Коллеги! Исправил две мои ошибки в формулировках в презентации. Исправления выделены красным.

Shame on my head. Объясняю тем, что редактировал презентацию глубокой ночью :)

Благодарю Сергея Александровича за то, что он заметил ошибки и сообщил мне.

Советую накануне занятия 12-го мая посмотреть про домены в презентации.

С.А.С. планирует устроить обсуждение определения доменов на следующем занятии.

ААл

7 мая

Коллеги!

Отредактировал текст подсказок по практикуму 13 и добавил кое-что.

Советую даже тем, кто уже выполнил задание, просмотреть добавления, чтобы исправить отчет, если потребуется.

ААл

Блок 1: HTML, CSS, основы веб-дизайна.

1. Введение в HTML, основы CSS

11 февраля А. Злобин, В. Маслова

Будьте внимательны с тем, какие кавычки используете в коде! " (Ru: Shift+2) и " (Eng: Shift+Э) выглядят похоже, но только вторые годятся. Более того, при копировании моего кода из гуглпрезентаций правильные кавычки почему-то автоматически заменяются на неправильные. Смотрите код в исходниках страниц! — АЗло

[ презентация ] [ текст "практикума" ] [ задания ]

2. CSS, Bootstrap

18 февраля В. Маслова, А. Злобин

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки и ссылки ]

Блок 2: 3D структуры белков

3. Структура белка. Jmol

25 февраля 2020

А. Залевский, А. Злобин

[презентация] [задания] [подсказки] [видеогайд по J(S)Mol] [описание J(S)Mol] [Jmol faq]

4. Атлас контактов

3 марта 2020

А. Залевский, А. Злобин

[ комментарии к домашнему заданию ] [презентация] [задание]

5. Мембранные белки

10 марта 2020

А. Залевский

[ презентация ]

6. Лиганды/малые молекулы

17 марта 2020

А. Залевский

[ презентация ] [ видеозапись ]

7. Коллоквиум

24 марта 2020

А. Залевский, А. Злобин, В. Маслова

[вопросы] [запись для сдачи]

Блок 3: Банки белковых последовательностей

8. UniProt

31 марта 2020

И. Русинов, С.А. Спирин

[презентация] [задания] [комментарии] [видеозапись]

9. Proteomes. EMBOSS

7 апреля 2020

И. Русинов, С.А. Спирин

[презентация Proteomes] [презентация EMBOSS] [задания] [видеозапись]

Блок 4: Выравнивание последовательностей

10. Выравнивание как отражение эволюции. Программы парного выравнивания. Jalview.

14 апреля 2020

С.А. Спирин, И.С. Русинов

[презентация] [задания] [подсказки] [видеозапись]

11. Программа BLAST

21 апреля 2020

С.А. Спирин, И.С. Русинов

[презентация] [задания] [подсказки] [видеозапись]

12. Алгоритм BLAST, матрицы BLOSUM, карты локального сходства

28 апреля 2020

С.А. Спирин, И.С. Русинов

[презентация] [задания] [видеозапись]

13. Алгоритмы множественного выравнивания, эволюционные домены белков

5 мая 2020

А.В. Алексеевский

[презентация] [задания] [подсказки] [видеозапись] [комментарии при проверке]

14. Дополнительная лекция: алгоритмы выравнивания

12 мая 2020

С.А. Спирин

[презентация] [задания] [видеозапись]

15. Коллоквиум по блокам 3 и 4

19 мая 2020

Все

[процедура и варианты] [программа]

2019/2 (последним исправлял пользователь is_rusinov 2024-04-05 17:19:54)