2024
2023
2022
2021
2020
2018
2017
2016
Указания
2.
NCBI борется разными способами с перегрузкой серверов заданиями BLAST.
Может отказаться выполнять слишком большое задание.
Чтобы уменьшить вычислительную сложность задания можно ограничить область поиска: таксоном любого уровня, убрать из области Exclude Uncultured/environmental sample sequences
Исключить таксон, из которого входная последовательность, можно двумя способами
- Первый - предпочтительный - исключить из области поиска.
- Второй - отфильтровать (exclude) выдачу BLAST
Что делать если нет находок, кроме как того же вида, что входная последовательность
- Проверить сколько находок заказали при запуске BLAST. Увеличить.
- Уменьшить длину слова
- Взять другую входную последовательность