Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2020
XXXXXXX замените на вашу фамилию, написанную латинскими буквами
1. Создайте в своем эккаунте на kodomo директории:
- term1/block3
- term1/block3/credits
- term1/block3/pr11
2. Скачайте файлы с данными о вашей бактерии
- Файл ..._feature_table.txt.gz
- Разархивируйте и переименуйте в XXXXXXX_feature_table.txt
- Файл ..._genomic_fna.gz
- Разархивируйте ..._genomic_fna.gz, переименуйте в XXXXXXX_genome.fasta и скопируйте на kodomo в директорию term1/block3/credits
3. Импортируйте XXXXXXX_feature_table.txt в электронную таблицу (ЭТ)
- Создайте ЭТ XXXXXXX_suppl как Google Sheet или файл в формате Excel .xlsx
Импортируйте данные и назовите страницу feat_table Таблица должна содержать все данные из хромосомной таблицы (по столбцам, но без изменений)
Создайте страницу genes. Эта страница должна содержать плоскую таблицу со списком генов и всей информацией о них, см. помощь
- Для раздела "Материалы и методы" мини-обзора запишите и сохраните список умений, примененных вами при выполнении этого пункта
4. Напишите часть раздела Введение мини-обзора
- Ту часть, которая содержит информацию о бактерии из литературных источников
Ссылки на источники обязательны! Прочтите правила цитирования
- Выберите образец форматирования. Переименуйте файл. Создайте ссылку на него с вашей wiki В нем и сохраните чистовой текст
- Лимита в 120 слов на введение (до фразы о том, что сделано в работе) должно хватить
- Можно включать информацию о том, чем интересна бактерия или архея, какие особенности, где обитает, что-то о таксономии (не всю), число хромосом и плазмид, размер генома в парах нуклеотидов.
- Можно включать фотографию со ссылкой на источник. Обязательна подпись под рисунком.
Не обязательно включать все перечисленное, включайте только то, что вам кажется важным.
Задания этого практикума проверю и оценю. Для этого запишитесь в очередь до deadline'ов.
Задание в порядке личной инициативы
В каком-нибудь из доменов клеточных организмов или бесклеточных форм жизни (вирусов и вроде) найдите самый маленький и самый большой геном.
Находку внесите в [ таблицу ] (файл открыт для заполнения), ссылка на первоисточник обязательна!!!