2024
2023
2022
2021
2019
2018
2017
2016
Практические задания на коллоквиуме
Тема 2: Позиционная весовая матрица
Дано выравнивание последовательностей одного сигнала и последовательности для тестирования. 1)Постройте позиционную весовую матрицу 2)вычислите вес тестовых последовательностей относительно неё
Сдайте проверяющему.
Тема 3: Информационное содержание
Дано выравнивание последовательностей одного сигнала 1) Вычислите информационное содержание сигнала. Оцените приблизительно силу сигнала: сколько раз он встретится в случайной последовательности из 10000 нуклеотидов. 2) Постройте LOGO сигнала с помощью сервиса.
Сдайте проверяющему.
Тема 6: PSI-BLAST
Для данной последовательности белка найдите семейство его гомологов с помощью PSI-BLAST
Сдайте проверяющему.
Тема 8: Pfam
Отвечающий может выбрать семейство доменов сам. Если нет - согласует выбор с принимающим.