Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2020
Статьи, помеченные (#) можно найти на диске P/.../intexts
1 апр 2021
Подготовка к тесту
ААл
Under construction Пока открываю текст с прошлого года. В выходные отредактирую. ААл.
Сигналы (то, на что не хватило времени в лекциях; а нужно - для теста)
Про сигнал знать
- название
- тип сигнала - в чем состоит
- каким белкам или комплексам белков адресован
- Расположение относительно др сигналов и генов
Не ожидается, что студент знает все особые ситуации и альтернативные механизмы (но и не запрещается знать:) ). Достаточно знать один, наиболее распространенный или наиболее изученный.
Для сдачи теста нужно знать следующие сигналы
Прокариоты
- сигналы старта транскрипции
- сигналы терминации транскрипции
- Сигнал инициации трансляции
- Сигнал программируемого сдвига рамки считывания
- Сигнал терминации трансляции
- Место старта репликации (* пока плохо сформулировано)
- Сигналы регуляции транскрипции транскрипционными факторами
- Сигналы систем рестрикции-модификации
- Сигналы репарации ДНК (?? найти лит-ру)
Эукариоты
- сигналы старта транскрипции
- сигналы терминации транскрипции (?)
- сигнал полиаденилирования мРНК
- сигналы, отличающие мРНК от всех остальных типов РНК в циптоплазме
Wu, Brewer, 2012 Дополнительные адресаты этих сигналов. Советую смотреть ТОЛЬКО Fig.1, расположенный в конце эл. текста.
Сигнал инициации трансляции (места посадки рибосомы!)
- (*) Альтернативные сигналы инициации трансляции Shatsky et al., 2018, Trends Biochem Sci. (#)
Сигнал старта трансляции (с какого кодона начинается трансляция)
Hernandez et al., 2019; включает также инфо о неканонических сигналах]]
- Сигнал программируемого сдвига рамки считывания
- Сигнал терминации трансляции
- Места старта репликации (* пока плохо сформулировано)
- Сигналы регуляции транскрипции транскрипционными факторами
- Сигналы репарации ДНК (?? найти лит-ру)
- Сигналы сплайсинга (подобрать литру и картинки)
Теперь так. 4 апр. В воскресенье немного упорядочил презентацию и добавил рис. из разных мест. Добавил пару ссылок на статьи.
Остаётся согласовать список тем ниже с наличными ссылками, рисунками и текстами. Кое-что придется убрать из списка. Пожалуй добавлю сигналы, перечисленные на последнем слайде презентации.
Не всё войдет в тест. Но будет вопрос: приведите сигнал, который не вошел в программу:) Еще тест надо отредактировать:( Когда успею? Но постараюсь:)
ААл