Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2020
Полезные ссылки
Пропуски занятий - если вы попустили занятие по уважительной причине, запишитесь в форму для пересчета баллов. Медицинские справки регистрируйте в учебной части.
Данные для проекта - необходимо запросить датасет или предложить свой. Все датасеты должны быть утверждены преподавателем. Если вам не понравился датасет, вы не можете придумать, как его проанализировать - можно запросить или предложить другой датасет неограниченное количество раз до 22 декабря. Можно брать не все данные, если их очень много; выберите случайно или по какому-либо признаку необходимое количество данных, не забудьте рассказать об этом.
Занятия
1. 2.09.2022. Введение в R, RStudio, вектор (Жарикова А.)
[QuizHW1] - подготовить к занятию №2
[HW1] - дедлайн 20.09.2022 (23:59)
2. 9.09.2022. Вектора, срезы, таблицы, матрицы (Жарикова А.)
[QuizHW2] - подготовить к занятию №3
[HW2] - дедлайн 27.09.2022 (23:59)
3. 16.09.2022. Списки, циклы. Установка пакетов. dplyr, stringr (Жарикова А.)
[QuizHW3] - подготовить к занятию №4
HW3 - дедлайн 14 октября (11:00)
4. 23.09.2022. forcats, ggplot2 (Валяева А.)
[QuizHW4] - подготовить к занятию №5
HW4 - дедлайн 10.10.2022 (23:59)
5. 30.09.2022. ggplot2, "длинный" и "широкий" форматы данных, функции, dplyr (Валяева А.А.)
[QuizHW5] - подготовить к занятию №6
HW5 - дедлайн 18.10.2022 (23:59)
6. 7.10.2022. Функции, работа с ошибками, работа с цветом на графиках, теплокарты (Валяева А.А., Жарикова А.А.)
HW6 - дедлайн 24.10.2022 (23:59)
7. 14.10.2022. Контрольная работа
8. 21.10.2022. Концепция P-value. Взаимодействие двух переменных. z-test. t-test. chi-square contingency test. Корреляция.
9. 28.10.2022. Практическая работа по анализу взаимодействия двух переменных
10. 11.11.2022. Линейная регрессия. ANOVA. Проблема множественного тестирования
11. 18.11.2022. Практическая работа по линейной регрессии, ANOVA и проблеме множественного тестирования
12. 25.11.2022. Проверка гипотез о распределении одной переменной. ks-test. хи-квадрат тест goodnes of fit. PCA. tSNE. UMAP
13. 02.12.2022. Практическая работа по проверке гипотез о распределении одной переменной, PCA, tSNE, UMAP
14. 09.12.2022. Анализ дифференциальной экспрессии (А.А. Валяева)
15. 06.12.2022. Визуализация результатов (А.А. Жарикова)