Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2021
Задания практикума 2
- Выбрать бактерию или архею с известным геномом для анализа и составления мини-отчёта в конце семестра. Найти в wikipedia или ещё где-нибудь что-нибудь про свою бактерию/архею и написать пару фраз о ней на своей wiki странице (пригодится для мини-обзора).
Зайти на kodomo по протоколу ssh. Завести в домашней директории поддиректорию term1 (если вы не сделали это на занятии), а в ней — поддиректорию genome. Перейти в эту директорию и скачать в неё два файла: геном своей бактерии или археи в формате fasta (файл с именем, заканчивающимся на "genomic.fna.gz"; если таких файлов несколько, то тот, в чьём названии нет слов "from", "cds" или чего-то похожего) и таблицу особенностей (файл с именем, заканчивающимся на "feature_table.txt.gz"). Распаковать оба файла командой gunzip. См. указания.
Сделав оба задания, не забудьте записаться в очередь.