2023
2021
2020
2019
2018
2017
2016
2015
Основное и единственное задание блока 5
При написании мини-обзора в виде пригодном для проверки запишитесь в очередь на проверку практикума 14. "Пригоден для проверки" в том случае, если в тексте нет недописанных фраз или другого бардака. Если не всё выполнено - не страшно, позднейшая доработка возможна.
Написать мини-обзор о выбранной вами бактерии или архее, геном которой секвенирован
Зачёт по результатам проверки написанного вами мини-обзора обязателен для получения зачёта в семестре
Не хочу, чтобы это задание было для вас тяжкой обузой. Рассматриваю его как способ проявить себя. И, в идеале, получить удовольствие от того, что сделано что-нибудь интересное. Тем более, что обязательных заданий в других блоках много, и штатного времени на написание мини-обзора в этом году на предусмотрено.
Поэтому ограничиваю число обязательных тем исследований генома по минимуму. Зачёт можно получить даже за выполнение только обязательных заданий. При условии, что обзор составлен хорошо, и в нем есть выводы или ваши соображения по поводу полученных результатов.
Конечно лучше (и больше баллов получите) если придумает исследование самостоятельно и выполните его или возьмёте одно из дополнительно предложенных исследований.
Темы обязательных и дополнительных исследований найдёте по ссылке https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/2022/1/mini_review-task
Рекомендую такой порядок работы над текстом
Введение про свою бактерию или архею вам уже задано. Предлагаю завести файл с мини-обзором взяв образец форматирования из папки /P/y22/term1/Minireview. В нем образцы предлагаемые солидными журналами NAR (Nucleid Acids Research) и Microorganisms, слегка подредактированные мной для ваших текстов.
Начать с того, чтобы включить уже написанное вами введение в этот файл. Другие форматы (ранее бывшие в этой папке) брать не советую – намучаетесь, и не всё в них понятно. Но если уже взяли, и справились с форматами - оставьте.
Важно содержание и наличие разделов, а к форматам при проверке придираться не будем.
В раздел Материалы и Методы добавьте названия файлов с последовательностями генома и хромосомной таблицей. Адрес (на kodomo или в google doc), по которому проверяющий может посмотреть их содержание включите в раздел Сопроводительные материалы.
В раздел Результаты добавьте Подраздел о составе и размере генома и числе генов в геноме и м.б. другие данные уже полученные вами по обязательным заданиям.
В раздел Литература (в котором ссылки на литературные источники) добавьте ссылку на статью, по которой вы написали введение. Если введение писали по wiki то укажите интернет адрес. В науке ссылки на интернет недопустимы – только на опубликованные данные. Но всегда честность важнее, а вы пока не рукопись в журнал подаёте.
В результате получится, что непустой черновик мини-обзора у вас уже есть, а времени на это уйдёт не так много. Поверьте, такая работа сильно вас приблизит к завершению мини-обзора и его зачёту.
Время от времени добавляйте новые подразделы. Призываю не стараться напихать всего побольше в мини-обзор, а качественно выполнить каждое исследование и хорошо представить и обсудить его результат в обзоре. "Хорошо" значит просто и понятно читателю. Подумайте о том, будут ли понятны обозначения на рисунке и подписи осей на графике. Аббревиатуры, выдаваемые программами часто не общеизвестны. Лучше расшифруйте их в подписи к рисунке. Соблюдайте меру, аббревиатуру ДНК расшифровывать не стоит. И т.п. Важны ваши соображения по поводу полученных результатов. Буду рад их увидеть и оценю, даже если они покажутся мне ошибочными: "Что есть истина?"
Когда по вашему впечатлению в мини-обзоре будет связный текст, пусть и не законченный с вашей точки зрения, запишитесь в очередь с комментарием ЧЕРНОВИК. Я просмотрю и, возможно, прокомментирую. Мне бы хотелось видеть даже ваши черновики до 2 декабря, так как на занятии 2 декабря (в рамках блока python) часть времени будет дана на обсуждение тем и ваших успехов по написанию мини-обзора. На последнем занятии 16 декабря обсудим ваши, м.б. ещё незавершенные мини-обзоры, и что доделать, чтобы получить зачёт за мини-обзор.
Как-то так, получается не просто, но давайте попробуем справиться. Я решительный сторонник того, чтобы не разделять обучение методам с обучением биоинформатике в молекулярной биологии.
Указания по выполнению некоторых исследований найдёте по адресу https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/2022/1/mini_review-hints
Можно придумывать свои темы для исследования и результаты включить в мини-обзор. Творчество и фантазии (в рамках того, что можно проверить) приветствуются. Если хотите заранее получить отклик от преподавателей на предлагаемую вами новую тему исследования или задать любой вопрос, касающийся мини-обзора, воспользуйтесь google таблицей. Доступ на запись открыл всем, кроме Артёма Емельянова, который не прислал адрес gmail.com. При входе может быть придётся вводить gmail пароль.
ААл