2024
2023
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Семестр 1. Объекты и инструменты, первое знакомство
Результаты Только для студентов и преподавателей
При проблемах доступа к ведомости пишите на valmarfgecnf@gmail.com. Пожалуйста, указывайте своё имя в письме.
8 марта 2023
Информация о рейтинге за 1й семестр.
Рейтинги за мини-обзор увеличил,
умножением взвешенной суммы баллов за задания на 2.
Обоснование: медиана баллов за мини-обзор была 8.6, что вдвое меньше медиан за другие блоки. Что рассматриваю как свой недосмотр при составлении формулы в Google Sheet для суммирования баллов.
ААлЗаписаться в очередь на проверку
Заполните эту форму при выполнении всех обязательных заданий практикума. Дата заполнения формы автоматически фиксируется как дата выполнения заданий
Список записавшихся в очередь на проверку
Блок 1: Знакомство, настройка учётных записей, первые шаги
1. Знакомство. Что такое биоинформатика?
2 сентября 2022
А.С. Злобин
(а также Л.К. Смиренина, И.С. Русинов, А.А. Жарикова, А.В. Алексеевский, С.А. Спирин, Д.Д. Пензар и др. преподаватели)
2. Геном бактерии как файл. Подключение к серверу kodomo.
9 сентября 2022
С.А. Спирин, И.С. Русинов, А.В. Алексеевский
[ задания ] [ подсказки ] [ "Bacteria and Archaea for selection" ] [ форма сообщения о выбранном геноме ]
Блок 2: Элементы работы с интерпретатором командной строки bash
3. Bash. Работа с файлами
16 сентября 2022
И. Русинов, С.А. Спирин, А.В. Алексеевский
4. SFTP, спец. символы bash, текстовые файлы
23 сентября 2022
И. Русинов, С.А. Спирин, А.В. Алексеевский
[ задания ]
5. Потоки ввода/вывода, метаданные, работа с текстом
30 сентября 2022
И. Русинов, С.А. Спирин
[ задания ] [ видеозапись с прошлого года ]
6. Исполняемые файлы. Контрольная
7 октября 2022
И. Русинов, С.А. Спирин
[ задания ] [ темы контрольной ] [ видеозапись с прошлого года ]
Блок 3: Электронные таблицы
7. Принципы устройства, импорт данных, базовые методы
14 октября 2022
С.А. Спирин, И. Русинов
[ задания ]
8. Гистограммы, диаграммы, вертикальный просмотр
21 октября 2022
С.А. Спирин, И. Русинов
[ задания ]
[ введение к мини-обзору (к 1 ноября)]
Блок 4: Программирование на Python
9. Базовый Python
28 октября 2022
Дмитрий Босов, Даниил Хлебников
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ] Дедлайн: 11 ноября 23:59
10. f-строки. Условные конструкции и цикл for.
11 ноября 2022
Даниил Хлебников, Дмитрий Босов
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ] Дедлайн: 18 ноября 23:59
11. Цикл while. Списки.
18 ноября 2022
Дмитрий Босов, Даниил Хлебников
[ Лекция в Colab ] [ Домашнее задание в системе ejudge ]
Дедлайн: 25 ноября 23:59
12. Словари. Множества.
25 ноября 2022
Даниил Хлебников, Дмитрий Босов
[ Лекция в Colab ]
[ Домашнее задание в системе ejudge ]
Дедлайн: 2 декабря 23:59
13. Коротко о мини-обзоре. Основы работы с файлами. Формат Fasta. Bed-формат. Модули в Python: os, sys, glob.
2 декабря 2022
Дмитрий Босов, Даниил Хлебников
[ Лекция в Colab ]
[ Домашнее задание в системе ejudge ]
Дедлайн ejudge: 14 декабря 23:59
[ задание с выкладкой результатов на страничке ]
Дедлайн задания с выкладкой: 20 декабря 23:59
14. Функции. Модули в Python: random, collections.
9 декабря 2022
Даниил Хлебников, Дмитрий Босов
[ Лекция в Colab ]
Блок 5: Мини-обзор генома и протеома бактерии или археи
Составляется в течение семестра на основе выполненных заданий блоков 2–4 и собственных инициативных результатов, по вашему выбору.
Для тех, кто только приступает к составлению мини-обзора. По ссылке Указания добавил информацию о том, что включать в каждую из секции текста. По опыту проверок с этим было много ошибок. ААл
[ указания ]
[ google таблица для вопросов и предложения тем исследования ]
01 сентября 2022
Текст.
— Подпись