Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2022
Критерии оценки пр. 7
Можно проверять практикум, если в очереди номер 7 на зеленом фоне, и есть отметка auto в графе "Комментарии проверяющего". Перед проверкой надо поставить отметку в графе проверяющий.
1. Выбор белка
Требуются (если один из пунктов отсутствует или содержит ошибку, то задание не зачитывается, т.е. менее 2.5 баллов в ведомости):
- запрос для получения списка белков, должен содержать условие на taxonomy (другие условия опционально);
- идентификатор (AC или ID) выбранного белка, нужно проверить PE белка, если 4, то должно быть пояснение выбора такого белка, 5 нельзя;
- пояснение выбора белка (если отсутствует, то не более 2.5 за задание).
Если хочется за что-то добавить/убрать баллы, то лучше в колонки Штраф/Бонус их проставлять, лучше с комментарием. Это всех пунктов касается.
2. Информация о белке
Требуются:
перевод названия белка на русский язык, самая частая ошибка – неправильное соединение слов на манер английского языка: ДНК гидролаза, фосфопируват гидролаза и т.д. (правильно ДНК-гидролаза или гидролаза ДНК, фосфопируватгидролаза);
- краткое описание функции белка.
3* Кластеры похожих белков
Может отсутствовать, наличие оценки за этот пункт на зачет влиять не будет. Если есть рассуждения о том, как по кластерам можно оценивать распространенность белка, его консервативность, или еще что-то, то их надо оценить.
4. Поисковые запросы
Требуются:
- не менее трех запросов, достаточно разнообразных (в техническом плане). Если приведено много однообразных запросов, можно немножко снизить балл.
- Если хоть в одном запросе есть поиск по всему тексту записи, то должно быть пояснение, почему было решено сделать так;
- по каждому запросу должно быть приведено количество находок.
Запрос – это текст, скопированный из поисковой строки, а не скриншот, описание словами, или еще что-то.
Оценить надо то, описано ли предназначение запросов, и то, на сколько они реально позволяют ответить на поставленные вопросы (оценивать нестрого, если есть способ значительно улучшить запрос, хорошо бы указать его в комментариях).
5* Поиск источника аннотации
Оценка на свое усмотрение, но строгая. Дополнительные задания оцениваются с большим коэффициентом, но не хочется поощрять некачественное выполнение исключительно для получения дополнительных баллов.