Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2023

Задания на дом

  1. Импортируйте в файл Google Sheet (имя файла xxxxxxx_genome) таблицу особенностей вашей бактерии или археи

В файле должно быть пять страниц

Имя страницы

Содержание

Комментарии

feature_table

Скачанная таблица

Первой колонкой должна быть добавлена колонка идентификаторов - номеров строк (line_id, 1, 2, 3 ... )

protein_cds

Таблица с информацией обо всех белках

lineID, locus_tag, и все колонки, характеризующие белки, БЕЗ столбцов, ничего не характеризующих (все значения одинаковы), БЕЗ ПОВТОРОВ — столбцов с одинаковой информацией

RNAs

Таблица с информацией обо всех РНК

lineID, locus_tag, и все колонки, характеризующие РНК

comments

Тексты с пояснениями для проверяющих

Коротко и понятно; комментариев может и не быть

tmp

Для проб

Не обязательна; не проверяется

2. Скачайте в свою директорию ~/term1/genome на kodomo файл с кодирующими последовательностями всех белков (... cds_from-genomic.fna), закодированных в геноме вашего организма.

CDS = Coding DNA Sequence, последовательность нуклеотидов, кодирующая белок

2023/1/pr7 (последним исправлял пользователь sas 2023-10-22 16:38:27)