Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2024

1. Toy educational task

Не обязательное

Задание и подсказки хранятся в этом файле https://docs.google.com/presentation/d/1bsRgIgsK6641ZQTA8XknL4NY6RD4yJTO/edit?usp=sharing&ouid=114112330860244990377&rtpof=true&sd=true

2. Импортируйте в свой Google Sheets таблицы с информацией о генах в выбранном ранее геноме

Обязательное! Нужно закончить до вечера 18 октября и записаться в очередь, задание 7_class

Создайте в Google Sheets новую книгу и назовите её CDS

Инструкцию см. здесь https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/2024/1/hints_class_work7

Поставьте ссылку на эту книгу на своей wiki странице.

3. Создайте гистограмму длин белков, т.е. числа аминокислотных остатков в белке

На дом, но лучше начать в классе

3.1. Создайте в Google Sheets новую страницу и назовите её prot_lengths_hist

3.2. Скопируйте на эту страницу колонку с длинами генов в колонку A

3.3. В соседней колонке B вычислите длину белка закодированного в гене по формуле ((дл.гена/3)-1). Минус 1 потому, что в ген входит стоп кодон, но он не кодирует аминокислотного остатка

3.4. вычислите минимальную и максимальную длину белка. Используйте функции MIN(Диапазон) и MAX(диапазон)

3.5. Выберите длину каждого кармана гистограммы такой, чтобы охватить все длины и карманов было бы не слишлом много, не более пары десятков. Напишите в ячейке эту длину. Пусть это число лежит в ячейке D1 и равно 50.

3.6. Для вычисления числа длин попавших в каждый карман потребуется три колонки. В первой, скажем колонке E, написаны границы карманов, например 40, 90, 140, 190, .... Каждое следующее значение равно предыдущему плюс D1. Распространите эту формулу вниз так чтобы покрыть максимальную длину белка.

3.7. В соседней колонке сгенерируйте подписи карманов вида E(i-1) - Ei. Здесь i номер текущей строки, - не минус между E(i-1) и Ei не минус, а чёрточка. Это делается соединением значений функцией =Еi-1&"-"&Ei

3.8. В колонке G найдите число длин белков попадающих в карман от E(i-1) до Ei. Это делается функцией =COUNTIFS(B:B,">="&E(i-1), B:B, "<"& Ei)

не пугайтесь - покажем.

3.9 Выделите колонки F и G И вставьте карту. Посмотрите какая больше подходит.

2024/1/class_work7 (последним исправлял пользователь sas 2024-10-18 07:39:41)