Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2024
1. Toy educational task
Не обязательное
Задание и подсказки хранятся в этом файле https://docs.google.com/presentation/d/1bsRgIgsK6641ZQTA8XknL4NY6RD4yJTO/edit?usp=sharing&ouid=114112330860244990377&rtpof=true&sd=true
2. Импортируйте в свой Google Sheets таблицы с информацией о генах в выбранном ранее геноме
Обязательное! Нужно закончить до вечера 18 октября и записаться в очередь, задание 7_class
Создайте в Google Sheets новую книгу и назовите её CDS
Инструкцию см. здесь https://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/2024/1/hints_class_work7
Поставьте ссылку на эту книгу на своей wiki странице.
3. Создайте гистограмму длин белков, т.е. числа аминокислотных остатков в белке
На дом, но лучше начать в классе
3.1. Создайте в Google Sheets новую страницу и назовите её prot_lengths_hist
3.2. Скопируйте на эту страницу колонку с длинами генов в колонку A
3.3. В соседней колонке B вычислите длину белка закодированного в гене по формуле ((дл.гена/3)-1). Минус 1 потому, что в ген входит стоп кодон, но он не кодирует аминокислотного остатка
3.4. вычислите минимальную и максимальную длину белка. Используйте функции MIN(Диапазон) и MAX(диапазон)
3.5. Выберите длину каждого кармана гистограммы такой, чтобы охватить все длины и карманов было бы не слишлом много, не более пары десятков. Напишите в ячейке эту длину. Пусть это число лежит в ячейке D1 и равно 50.
3.6. Для вычисления числа длин попавших в каждый карман потребуется три колонки. В первой, скажем колонке E, написаны границы карманов, например 40, 90, 140, 190, .... Каждое следующее значение равно предыдущему плюс D1. Распространите эту формулу вниз так чтобы покрыть максимальную длину белка.
3.7. В соседней колонке сгенерируйте подписи карманов вида E(i-1) - Ei. Здесь i номер текущей строки, - не минус между E(i-1) и Ei не минус, а чёрточка. Это делается соединением значений функцией =Еi-1&"-"&Ei
3.8. В колонке G найдите число длин белков попадающих в карман от E(i-1) до Ei. Это делается функцией =COUNTIFS(B:B,">="&E(i-1), B:B, "<"& Ei)
не пугайтесь - покажем.
3.9 Выделите колонки F и G И вставьте карту. Посмотрите какая больше подходит.