2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Обязательные задания
1. Придумайте своё пользовательское имя для регистрации на учебном сервере kodomo.fbb.msu.ru
Обязательно выполните до вечера среды 11 сентября! Иначе на занятии у вас не будет аккаунта.
Заполните форму.
2. Выберите бактерию или архею для изучения в дальнейшем её генома
Обязательно выполните до занятия 13 сентября! Иначе не сможете выполнить задания в классе.
Посмотрите, какие организмы уже выбраны, в таблице (см. колонку "Selected"). Выберите какой-нибудь "незанятый" организм.
Внесите ваш выбор в форму
Пояснение
Сдача текста отчёта о выбранной архее или бактерии с результатами вашего исследования её генома и протеома и зачёт этого отчёта проверяющим преподавателем обязателен для получения зачёта по биоинформатике за первый семестр.
Дополнительные задания
Ответы на дополнительные задания посылайте преподавателям по почте в виде связного текста.
3. Посмотреть видео (ссылка на стр.6 презентации ААл)
Настоятельно рекомендованное задание.
Напишите в письме, что труднее: обучение медвежонка передвижению по крутому снежнику, или выполнение задания на первом занятии по биоинформатике.
4. Ответьте на любое подмножество из перечисленных ниже вопросов
1. Найдите в Pubmed (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/) статью про PARIS и скачайте её текст себе.
Скачать текст статьи: ссылка natureporfolio => download pdf => назвать файл Burman-2024_PARIS чтобы загрузить на локальный компьютер => открыть файл.
Вопросы про Алексея Ливенского
Это один из авторов статьи про PARIS. Он выпускник ФББ и рассказывал про PARIS группам И2 и И4.
2. Напишите, где работает Алексей
Это можно узнать из списка аффилиаций в статье.
3. (*) В чём состоял вклад Ливенского в работу?
Найти раздел Author contribution или спросить Алексея.
4. В каком году А. Ливенский защитил диплом?
Можно догадаться по информации, которая есть на сайте kodomo.fbb.msu.ru.
5. На каком месте по баллам за первый семестр учёбы был Алексей Ливенский?
Вряд ли у вас получится добыть эту информацию =)
Вопросы по статье про PARIS
6. Каким методом расшифровали пространственную структуру комплекса молекул белков?
Почитайте раздел Summary в статье.
7. Сколько белков в комплексе AriA c AriB?
Fig. 1e и его описание в Results.
8. Как расшифровывается PARIS?
Раздел Main text.
9. (**) Пришлите результаты обдумывания защитной антифаговой системы PARIS
Другие вопросы
10. Как обозначается аминокислотный остаток лизин одной буквой?
11. Сколько белков в банке UniProt имеют РНКазный домен, как у AriB?
Я обнаглел! Этого задания не делайте ни за что НИКОГДА!!! За это, т.е. НЕДЕЛАНИЕ, даётся плюс один балл при получении письма.
— ААл
Домен – это кусочек последовательности белка, отвечающий за какую-то функцию. РНКаза занимается расщеплением РНК.