|
|
Практика №2: Поисковые системы.
1. Сравнение трех поисковых систем
1. В UniProt отсутствуют даты публикации информации о белке
2. Поле "Gene names" SRS очень неудобно =(
3. В MRS очень доступное и понятное описание организма.
4. В Uniprot гиперссылки стоят прямо в тексте.
5. MRS подчеркивает участок в fasta-коде при наведении курсора в панели информации о вторичной структуре.
2. Ответ на вопрос.
Вопрос: Названия каких таксонов начинаются на "bacil"?
Ответ: bacillaceae, bacillales, bacillariaceae, bacillariales, bacillariophyceae, bacillariophycidae, bacillariophyta, bacillus.
Вопрос: Сколько в банке SwissProt записей, описывающих белки из рода Bacillus?
Ответ: 15224.
Вопрос: Сколько в банке SwissProt записей, описывающих белки из отдела Firmicutes?
Ответ: 67277.
3. Таблица.
| Формулировка функции белка |
Строка запроса |
Количество найденных документов |
| Surfactin synthase subunit 3 |
([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & [swissprot-Description:Surfactin synthase subunit 3*]) |
1
|
4. Последовательности белка
Ссылка на fasta-последовательность
|
|
