|
|
|
|
|
|
Практика №13. Вторичная структура.
1. Общее описание вторичной структуры 1JMK.
- Количество водородных связей - 318
- Количество альфа-спиралей - 22
- Количество бета-складок - 24
- Количество бета-поворотов - 49
Белок альфа+бета структурный, так как имеются альфа- и бета-участки, но отсутствует периодичность.
2. Альфа-спираль
- вся цепь C в ленточной модели, альфа-спираль 142-162 выделена зеленым цветом
- Вся выбранная альфа-спираль
- Водородные связи между атомами остова
Водородная связь между кислородом i-того и азотом i+4-того остатков.
3. Бета-листы
- вся цепь C в ленточной модели, бетя-тяжи выделены синим цветом
- Все выбранные бета-тяжи (наш тяж параллелен с одним из тяжей и антипараллелен с другим)
- Водородные связи между атомами остова
4. Реверсивный поворот
Поворот: PRO-PRO-VAL-LEU-GLY
В этом повороте имеется целая одна водородная связь!
|