4 семестр

Блок 1: Молекулярная филогения

Практикум 1

Что такое филогенетическое дерево.

Практикум 2

Реконструкция филогении.

Практикум 3

Укоренение и бутстрэп.

Коллоквиум 1

Материалы к коллоквиуму по первому блоку.

Блок 2: Профили, сигналы и эволюционные домены

Практикум 5

Сигналы, мотивы, PWM.

Практикум 6

Мотивы в белках. PSSM и паттерны. PSI-BLAST. Банк Prosite.

Практикум 7

Домены. Pfam. HMM профиль.

Практикум 8

Домены. Pfam. HMM профиль.

Блок 3: Функциональные классы белков

Практикум 10

Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.

Практикум 11

Геномное окружение. База данных GO.

Практикум 12

Трансмембранные белки.