Второй семестр
Главная
Cравнение биологических текстов на примере аминокислотных последовательностей
Блок 1: Общие принципы сравнения последовательностей.
Банки данных Swiss-Prot и UniProt
Матрицы весов аминокислотных замен
Блок 2: Выравнивание
Глобальное и локальное выравнивание аминокислотных последовательностей
Контрольная работа за второй блок
Блок 3: Семейства белков
Сравнить множественное выравнивание, построенное программой ClustalW, с "правильным" выравниванием из BaliBase
Консервативные аминокислотные остатки в выборке 10 потенциальных ортологов белка HMP_ECOLI
Построение паттерна по множественному выравниванию
Данные Pfam о белке HMP_ECOLI
Данные InterPro о белке HMP_ECOLI
PSI-BLAST
Реконструкция филогенетических деревьев
©
Тихонов Максим, 2005