Молекулярное Моделирование Биополимеров

• 1. Знакомство с Pymol
• 2. Работа с Pymol
• 3. Cеми-эмпирические вычисления: Mopac
• 4. Abinitio вычисления для нафталина и азулена
• 5. Вычисление валентных параметров для молекулярной механики
• 6. Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики
• 7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS
• 8-9. Анализ результатов моделирования поведения пептида в формамиде.
• 10. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
• 11. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
• 12. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка.