Учебный сайт Юдиной А.С.

Главная

Обо мне

Семестры

Второй семестр

Мы успешно преодолели испытание первой сессией: получили свои первые зачеты, волновались перед сдачей первых экзаменов.
И вот теперь, после приобретения нового жизненного опыта, мы готовы дальше грызть гранит науки и переходим к курсу втогоро семестра.

План курса:

  • Визуализация биомолекул с помощью Jmol. Мою работу по этой теме можно посмотреть здесь.
  • Изучение внутренностей белков: гидрофобные ядра, плотность упаковки атомов, взаимодействие с другими молекулами. Моя работа находится здесь.
  • Составлние атласа контактов для комплекса биомолекул. Для выполнения задания по этой теме мы разбились на группы, наша работа находится на странице Андрея Буяна.
  • Знакомство с базой данных UniProt, поиск информации о своём белке. Моя работа находится здесь.
  • Работа в среде Linux.
  • Использование пакета EMBOSS для работы с протеомом прокариотического организма.
  • Выравнивание последовательностей с использованием программы Jalview. Моя работа.
  • Парные выравнивания. Моя работа.
  • Поиск по сходству в программе BLAST. Моя работа.
  • Алгоритмы множественного выравнивания. Моя работа.

© Юдина Анастасия, 2016