Семестр 3

Рисование молекул в MarvinSketch

Рисуем нуклеотиды и фрагменты нуклеиновых кислот с помощью программы MarvinSketch.

Узнать подробнее
Анализ структуры нуклеиновых кислот

С помощью пакета 3DNA анализируем структуры ДНК и РНК.

Узнать подробнее
Комплексы ДНК-белок

Предсказываем вторичную структуру РНК и находм связи ДНК-белок.

Узнать подробнее
Секвенирование по Сенгеру

Собираем контиг из прямого и обратного рида ДНК.

Узнать подробнее
Нуклеотидные базы данных

Геномные сборки и записи в нуклеотидных базах данных.

Узнать подробнее
Нуклеотидный BLAST

Используем blastn, blastx, megablast

Узнать подробнее
Entrez Direct, BLAST+, EMBOSS

Испульзуем возможности Entrez Direct, BLAST+, EMBOSS для поиска гомологичных последовательностей белков в неаннотированном геноме

Узнать подробнее
Выравнивание геномов

С помощью программы NPG Explorer исследуем полногеномное выравнивание прокариот

Узнать подробнее
Сборка de novo

С помощью программы Velvet создаем контиги из чтений

Узнать подробнее