2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Адреса и подсказки
Карта бета-листа SheeP
- Определение типичных укладок в структуре (сэндвичи, баррели, пучек спиралей и т.п.) и мотивов.
Набор примеров см. на диске P: ... y10/Term_7/PDB_samples/
Пространственное совмещение без заданного соответствия атомов, поиск сходных структур PDBeFOLD
- Пространственное совмещение с заданным соответствием атомов.
Есть скрипт Kabsch.py для Pymol. Его надо скачать и изучить инструкцию как запускать. Старый вариант лежит также на диске P: в директории Scripts.
Нахождение гидрофобных кластеров в белке и на интерфейсеCluD.
Если проблемы с Jmol on-line, то пробуйте другие браузеры. В крайнем случае можно скачать Rasmol/Jmol скрипт.
- Построение поверхности, раскраска по заряду (ABPS в pymol)