Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2011

Семестры Студенты Преподаватели

• 2024
• 2023
• 2022
• 2021
• 2020
• 2019
• 2018
• 2017

• ...

Язык R и его применение в биоинформатике

Система для выполнения домашних заданий После регистрации пишите на fbbrcourse [собака] gmail.com, чтобы мы добавили вас в группу, тогда станут доступны домашние задания.

Наш список рассылки

[Шпаргалка по функциям]

Занятия

1. 11 фев. Введение. Знакомство с R-Studio. Базовый тип - вектор, dataframe. Графики.

   • [Lecture1]

2. 17 фев. Тип - матрица, список. Ввод - вывод. Начало статистики.

   • [Lecture2]

3. 25 фев. Тесты ассоциации, GWAS. if, for, apply, merge

   • Lecture3 Tutorial

4. 4 марта. Графики ggplot2

   • ggplot.pdf http://www.ceb-institute.org/bbs/wp-content/uploads/2011/09/handout_ggplot2.pdf

5. 11 марта. Повторение перед контрольной работой

   • Tutorial [file]

6. 18 марта.Контрольная работа.

   • [Файлы к контрольной работе] Результаты

7. 25 марта.Линейные модели, часть 1.

   • Slides Датасет - цены на ноутбуки Tutorial

8. 31 марта.Линейные модели, часть 2.

   • Slides Датасет - паттерны эпигенетических модификаций в промоторах и энхансерах Tutorial

9. 8 апреля.BioconductoR, дифференциальная экспрессия по данным RNA-seq

   • Slides Tutorial Multiple testing

10. 15 апреля.Кластеризация

    • Lecture Датасет частота слов в блогах - blogdata.csv Tutorial

11. 22 апреля. Классификаторы. SVM, нейросети и random forest.

Tutorial

1. 13 мая. Контрольная работа 2.

[Файлы к контрольной работе]