2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Практикум 1. Задания
Группа, у которой это занятие прошло 6 сентября, должна прислать (выложить) результаты выполнения практикума до 23:59 12 сентября, а группа, у которой занятие 7 сентября, - до 23:59 13 сентября.
Обязательные задания
Не забывайте смотреть подсказки к заданию, и не стесняйтесь спрашивать любого из преподавателей, если что-то не получается!
- Прочитайте Правила использования компьютерного класса ФББ МГУ и распишитесь в них. Сдайте преподавателям.
Заведите учетную запись на сервере kodomo. Если все прошло удачно, то Вы зарегистрированы на сервере kodomo как студент 1 курса ФББ. Вы можете пользоваться интернет-почтой https://kodomo.fbb.msu.ru/mail/ и заходить на сервер kodomo под своим пользовательским именем и со своим паролем как из компьютерного класса, так и с удаленного компьютера.
- Перезайдите в доменную систему под своим пользовательским именем.
Заведите почтовый ящик на Google Mail, если его еще нет.
Проверьте свой почтовый ящик на сервере kodomo, посмотрите его настройки. Пошлите преподавателям (ДД, СМ, ААл, САС) одно письмо с почты на сервере kodomo, содержащее:
- Вашу фамилию латинскими буквами с заглавной буквы в поле "Subject";
- приветствие преподавателям;
- несколько фраз о том, как Вы оцениваете свою компьютерную грамотность: какими программами умеете пользоваться, есть ли у Вас навыки программирования, как относитесь к компьютеру;
- пару фраз о том, насколько Вы владеете английским языком;
- любую другую информацию, которой Вам захотелось поделиться с преподавателями;
- Ваш адрес в Google Mail (один!);
подпись: Ваше имя (каким именем подписываетесь, так к Вам, обычно, и обращаются в ответном письме).
Желательно, чтобы по подписи Вас можно было идентифицировать из всех студентов ФББ!
Официальным языком считается русский! Правила русского языка, соответственно, должны соблюдаться!
Создайте свою рабочую директорию для текущего занятия: на диске H создайте директорию term1, в ней поддиректорию block1, в ней поддиректорию pr1.
В рабочей директории создайте файл протокола текущего занятия: <Familiya>_pr1.doc (или docx). Вместо <Familiya> начиная с этого занятия и далее нужно использовать одно и то же написание Вашей фамилии с заглавной буквы на английском языке без кавычек (то же самое, что Вы указали в теме первого письма).
- Озаглавьте его, укажите дату последнего изменения (ее нужно обновлять при каждой правке протокола).
- В паре предложений отметьте, что на этом занятии вызвало наибольшие сложности, или что сложностей не возникло.
Сохраните файл
Создайте директорию для зачетных заданий ("кредитов") текущего блока: term1/block1/credits на диске H. В конце работы файл протокола должен быть скопирован в директорию "кредитов" текущего блока!
Имена файлов всегда должны быть такими, как указано в задании (иначе ваши файлы могут оказаться непроверенными)!
В конце занятия отошлите второе письмо преподавателям, присоединив к нему файл протокола.
Задания можно выполнять/доделывать в часы работы компьютерного класса или дома.
Контрольное время сдачи большинства практикумов - 23:59 дня накануне следующего занятия, т.е. немного меньше недели. Опоздание карается штрафами и неопределенностью сроков проверки.
После проверки можно присылать исправленные работы с четкими указаниями, что исправлено. Исправленные задания обычно оцениваются не на максимальный балл, даже если выполнены правильно.
Дополнительные задания
* Определите время создания, объем в битах, байтах и килобайтах одного из файлов с расширением fasta, лежащего на диске P в директории y13. Используйте поиск.
- * Укажите в протоколе название выбранного файла. Опишите, что содержится в файле.
* Найдите повторы в последовательности. Выровняйте повторы вручную (см. образец в презентации).
* Посмотрите на слайд 15 в презентации, где описывается схема использования компонентов системы CRISPR/CAS в генной инженерии. Обратите внимание, что на РНК при взаимодействии с белком Cas9 изображена шпилька: сочетание из стебля и петли. Пример шпильки приведен на рисунке 1. Найдите и отметьте в протоколе участки повтора, образующие стебель, и объясните почему он образуется. Отметьте на рисунке или на самой последовательности расположение этих участков.
- * Какие фразы называют палиндромными в обычном языке? Приведите пример. Как Вы думаете, есть ли какие-то отличия в использовании слова "палиндром" применительно к геномным последовательностям? Как Вы считаете, почему в названии участков CRISPR присутствует слово "palindromic"?
|
Рис.1. Элементы вторичной структуры РНК: петля и стебель. |
Прочтите в подсказках, как надо выключать компьютер. Выключите компьютер.