2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Список вопросов
Для ответа можно использовать не только запись Uniprot, но и статьи, найденные в Pubmed. В этом случае должна быть приведена ссылка на источник.
- В какой части бактериальной клетки локализован Ваш белок? На какой участок вашего белка Вы бы стали воздействовать,чтобы помешать его правильной локализации в клетке?
- Какие аминокислотные остатки (номер, трехбуквенный код, русское название) Вы бы стали мутировать, чтобы повлиять на структурную целостность Вашего белка?
- Какие аминокислотные остатки Вы бы стали модифицировать, чтобы изменить характер связывания металла с белком?
- Какие аминокислотные остатки участвуют в образовании активного центра? (перечислите №№ позиций и полные названия)
- Какие ионы связываются с белком?
- Какие мутации Вашего бека исследованы? Какие аминокислотные остатки (русское название, трехбуквенный код, номер в цепи) мутировали и к чему это приводило?"
- Какие участки белка (напишите номера аминокислотных остатков) участвуют в связывании лиганда? Какого?
- Какой остаток или последовательность какого участка вашего белка была сначала опеределена поразному разнами исследователями?
- Какой функции этого белка посвящена одна из статей, упомянутых в записи?
- Мутация по какому аминокислотному остатку нарушит связывание белка с каким-либо субстратом?
- Напишите номера и названия аминокислотных остатков, чьи боковые цепи связаны ковалентной связью.
- Опишите функцию и состав комплекса, в который входит данный белок.
- Получите последовательность 2-й альфа-спирали, используя команду seqret пакета EMBOSS.
- Получите последовательность 3-го бета-тяжа, используя команду seqret пакета EMBOSS.
- Последовательности большинства белков начинаются с метионина. Почему? После биосинтеза в процессе созревания белка метионин может быть удален. Указан ли метионин в начальной позиции заданного белка? А удаляется ли он потом?
- Предложите мутации, влияющие на связывание с ДНК.
- Предложите мутацию, которая, на Ваш взгляд, сильно повлияет на активность белка. Ответ требует краткого обоснования
- Укажите аминокислотный остаток (русское название, трехбуквенный код, номер в цепи), который модифицируется в белке после его трансляции, и охарактеризуйте эту модификацию.
- Укажите аминокислотный остаток (русское название, трехбуквенный код, номер в цепи), необходимый для выполнения белком своей функции.
- Укажите вероятные полиморфизмы - отличия в последовательности белка, полученного из разных организмов того же вида.
- Укажите положение сигнального пептида в последовательности (от - до) и опишите роль этого пептида