Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2013
Семестр III. Структуры и последовательности нуклеиновых кислот
Блок 1: Структуры нуклеиновых кислот
1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)
2 сентября 2014, А.В. Головин
[ презентация ]
2. Химическое строение нуклеиновых кислот
9 сентября 2014, А.В. Головин
3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК
16 сентября 2014, А.В. Головин.
[ [задания ] [ [подсказки ]
4. Комплексы ДНК-белок
23 сентября 2014, А.В. Головин.
[ [задания ] [ [подсказки ]
5. Итоговая контрольная
30 сентября 2013, А.В.Головин
Блок 2: банки последовательностей нуклеиновых кислот
6. Нуклеотидные банки данных
7 октября 2014, С.А. Спирин и Ю.А. Пеков
[ презентация ] [ задания ]
7. EMBOSS
14 октября 2014, С.А. Спирин и Ю.А. Пеков
[ задания ]
8. Онлайн BLAST
21 октября 2014, С.А. Спирин и Ю.А. Пеков
[ презентация ] задания ]
9. Локальный BLAST
28 октября 2014, С.А. Спирин и Ю.А. Пеков
[ презентация ] [ задания ]
Блок 3: предсказание генов
10. Предсказание генов у прокариот
11 ноября 2014, С.А. Спирин
[ презентация ] [ задания ]
11. Предсказание генов у эукариот
18 ноября 2014, С.А. Спирин
[ задания ]
Блок 4: обработка данных секвенирования
12. Анализ качества и очистка чтений
25 ноября 2014, С.А.Спирин и Ю.А.Пеков
[ презентация ] [ задания ]
13. Картирование на референсный геном
2 декабря 2014, С.А.Спирин и Ю.А.Пеков
[ задания ]
14. SNP, индели и сборка
9 декабря 2014, С.А.Спирин и Ю.А.Пеков
[ задания ]
23 декабря - зачёт
Вносите выполненные задания 2-4 блоков в форму
Регулярные выражения для grep (дополнено 17 марта) Правила зачёта