Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2013

Семестры Студенты Преподаватели

• 2024
• 2023
• 2022
• 2021
• 2020
• 2019
• 2018
• 2017

• ...

Язык R и его применение в биоинформатике

RStudio

Система для выполнения домашних заданий После регистрации пишите на fbbrcourse [собака] gmail.com, чтобы мы добавили вас в группу, тогда станут доступны домашние задания.

[Шпаргалка по функциям]

Интенсив по R

1. 11 февраля День 1

   • [лекция1]

Tutorial

Tutorial_cleaning_data

Tutorial_markdown

2. 12 февраля День 2

• [лекция2]

Tutorial

Занятия

1. 2 сент. Введение. Знакомство с R-Studio. Базовый тип - вектор, dataframe. Графики.

   • [лекция1]

Tutorial

1. 16 сент. Data frame. Построение графиков.

   • [лекция2]

2. 23 сент. Факторы, файлы, статистика

   • [лекция3]

3. 30 сент. Тесты ассоциации, GWAS. if, for, apply, merge

   • [лекция4]Tutorial

4. 7 окт. Визуализация данных, ggplot2

   • [лекция5] cheatsheet гифка piecharts [gapmidder.txt]

5. 14 окт. Контрольная работа [Файлы к контрольной работе]

6. 21 окт. Линейные модели, часть 1.

   • [лекция 6] Датасет - цены на ноутбуки Tutorial

7. 28 окт.Линейные модели, часть 2.

   • [разбор контрольной][лекция 7]

   • Датасет - паттерны эпигенетических модификаций в промоторах и энхансерах

   • Tutorial

8. 11 ноября.Множественное тестирование, кластеризация.

   • [часть 1]

   • [часть 2]

9. 18 ноября. Многомерная статистика. Классификаторы: SVM.

   • [ Лекция - SVM ]

   • [ Tutorial ]

10. 24 ноября. BioconductoR, дифференциальная экспрессия по данным RNA-seq

    • Лекция - дифференциальная экспрессия

    • Tutorial

11. 1 декабря.Gene Ontology.

    • [Gene Ontology][выборка генов]

12. 9 декабря. Контрольная работа 2 [Файлы к контрольной работе]