2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Как скачать файл с совмещёнными структурами со страницы результата PDBeFold
Предполагается, что вы находитесь на странице "Multiple Alignment Results" сервиса PDBeFold, на которой отображены результаты структурного выравнивания. Со скачиванием выравнивания последовательноcтей проблем нет (кнопка download FASTA alignment), а вот скачивание файла с совмещёнными сруктурами может вызвать затруднения.
По умолчанию сервис предлагает посмотреть совмещение в Jmol. К сожалению, имеется в виду Java-апплет Jmol online, который (как и все Java-апплеты) заблокирован в большинстве браузеров. Поэтому надо действовать так:
- в меню Viewer выбираете Rasmol;
- нажимаете кнопку "view superposed";
- программа предлагает сохранить файл "send.rasmol", что вы и делаете.
Этот файл имеет формат, понимаемый обычным (оффлайновым) Jmol'ом. Если для чего-нибудь нужен обычный pdb-файл, можно создать его из Jmol командой write или же в текстовом редакторе, убрав начальные строки с командами.