2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Как скачать файл с совмещёнными структурами со страницы результата PDBeFold
Использование PDBeFold:
Находясь на странице сабмита выбираете режим pairwise и свой PDB-код
- Определитесь с набором цепей, по которому будет произведен поиск, и трешхолдами
- Жмете Submit
- На странице результатов выбираете свой белок (он первый) и несколько интересны находок (лучше не брать самые лучшие, вероятнее всего это тривиальные случаи того же белка, но закристаллизованного с другим лигандом).
В разделе FOR ALL CHECKED MATCHES выбираете submit (с галочкой на include query)
На странице Multile Alignment Results выбираете Viewer: Rasmol
- нажимаете кнопку "view superposed", программа предлагает сохранить файл "send.rasmol", что вы и делаете
Этот файл можно загрузить и Jmol, и PyMol. Отдельные белки из набора разнесены по цепям.