Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2018

Семестр 5. Язык R и анализ данных

Полезные ссылки

Правила

Язык R

RStudio

RStudio на kodomo

Ведомость

Занятия

1. 1.09.2020: Введение. RStudio. Markdown. Вектор - операции, создание. Срезы. Data frame

Презентация

Домашнее задание 1 Дедлайн: 15.09.2020

2. 7\8.09.2020: Встроенные наборы данных. Выбор строк, столбцов. Which. Сохранение и чтение данных. Работа с отсутствующими данными.

Презентация

Домашнее задание 2 Дедлайн: 26.09.2020

flights.RData

3. 14\15.09.2020: Факторы. Матрицы. Списки. Циклы (for, if, ifelse, next, break, while, repeat). Apply, lapply, sapply, vallpy, mapply.

Презентация

Домашнее задание 3 Дедлайн: 03.10.2020

4. 21\22.09.2020 Хэш-таблицы. Функции. Tidyverse. Основы dplyr.

Презентация

Домашнее задание 4 Дедлайн: 23:59 10.10.2020

5. Классы. S3, S4, S6. Статистические тесты в R.

Презентация

Домашнее задание 5 Дедлайн: 23:59 24.10.2020

6. 5\6.10.2020 - Контрольная работа №1.

Распределение по вариантам

Вариант 1 задания

Вариант 2 задания

Вариант 3 задания

Вариант 4 задания

covid_var1.tab

covid_var2.tab

covid_var3.tab

covid_var4.tab

Форма для ответов

7. 12\13.10.2020 Advanced dplyr. Tibble.

Презентация

Домашняя работа 6 Дедлайн: 23:59 03.11.2020

8. 19\20.10.2020 Ggplot

Еще много картинок с кодом

[презентация]

[dreisena]

Домашняя работа 7 Дедлайн: 07.11.2020

9. 26\27.10.2020 Ggplot. pivot_longer, pivot_wider.

[презентация]

[данные про бобров]

Домашняя работа 8 Дедлайн: 15.11.2020

10. 02\03.11.2020 Корреляция. Линейная регрессия. Презентация (на слайде 39 опечатка, R^2 - квадрат коэффициента корреляции Пирсона)

11. 09\10.11.2020 Кросс-валидация. Категориальные переменные в линейной регрессии. Glm. ANOVA, ее модификации.

Домашняя работа 9 дедлайн: 01.12.20

Презентация

12. 16\17.11.2020 Fixed effects model. Random effects model. Mixed effects model

Презентация

13. 23\24.11.2020 Контрольная работа

14. 30.11.2020\01.12.2020 Кластеризация.

15. 07.12.2020\08.12.2020 Методы понижение размерности.

16. 14.12.2020\15.12.2020 Работа с геномными интервалами

[презентация]

17. 21.12.2020\22.12.2020 Анализ дифференциальной экспрессии

[презентация]

18. 28.12.2020\29.12.2020 Доклад проекта