Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2020
Структуры и последовательности нуклеиновых кислот
Результаты Только для студентов и преподавателей
Записаться в очередь на проверку
Новости
Блок 1: Пространственные структуры нуклеиновых кислот
1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)
7 сентября 2021, А.В. Головин
[ презентация ]
2. Мини-контрольная. Химическое строение нуклеиновых кислот
14 сентября 2021, А.В. Головин, А.О. Залевский
3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК
21 сентября 2021, А.В. Головин.
[ задания ] [ подсказки ] [ ipynb ]
4. Комплексы ДНК-белок
28 сентября 2021, А.В. Головин, М. Мальков.
[ задания ] [ подсказки ] [ задания-jupyter ]
5. Итоговая контрольная
5 октября 2021, А.В. Головин
Блок 2: Последовательности нуклеиновых кислот
6. Секвенирование по Сэнгеру
12 октября 2021, С. Исаев, И. Русинов, А.В. Алексеевский
[ презентация ] [ задания ] [ код с лекции ]
7. Нуклеотидные банки данных
19 октября 2021, И. Русинов
[ презентация ] [ упражнения и задания ]
8. Нуклеотидный BLAST
26 октября 2021, И. Русинов
[ презентация ] [ задания ]
9. Entrez Direct, BLAST+, EMBOSS
2 ноября 2021, И. Русинов
[ презентация ] [ задания ] [ видеозапись ]
10. Выравнивание геномов
9 ноября 2021, А. Алексеевский, И. Русинов
[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ] [ задание для выполнения в день лекции ]
[ Программа NPG-explorer: инструкция и сайт для скачивания ]
Блок 3. Сборка и анализ геномов
11. Введение в анализ NGS
16 ноября 2021, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
Домашнее задание (см. Практикум 11)
Форма к домашнему заданию по практикуму 11
12. Введение в анализ NGS
23 ноября 2021, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
Домашнее задание (см. Практикум 12)
Форма к домашнему заданию по практикуму 12
13. Введение в анализ NGS - анализ транскриптомов
30 ноября 2021, Анастасия Жарикова
[ презентация ]
Домашнее задание (см. Практикум 13)
Форма к домашнему заданию по практикуму 13
14. Обсуждение домашнего задания. IGV. gnomAD.
7 декабря 2021, Анастасия Жарикова
Домашнее задание (см. Практикум 13)
15. Сборка de novo
14 декабря 2021, С.А.Спирин
[ презентация ] [ задания ]
16. Коллоквиум
21 декабря 2021
[ программа ]