Таблица 1.
Информация о гене белка моноаминоксидазы A в геномном браузере UCSC.
Имя гена
MAOA
Идентификатор гена в Gencode
ENSG00000189221.9
Цепь
+
Хромосома
chrX
Плечо и полоса хромосомы
p11.3
Число альтернативных транскриптов
2
Gencode ID первого транскрипта
ENST00000338702.3
Координаты первого транскрипта
hg38 chrX:43,656,219-43,746,821
Число экзонов первого транскрипта
15
Длина последовательности белка первого транскрипта
527
Gencode ID второго транскрипта
ENST00000542639.5
Координаты второго транскрипта
hg38 chrX:43,654,907-43,746,824
Число экзонов второго транскрипта
16 (кодирующих - 12)
Длина последовательности белка второго транскрипта
394
Рис. 1.Окрестность гена MAOA из Genome Browser с избранными треками.
Ensembl
Выравнивание генов MAOA человека и шимпанзе было получено в Ensembl, затем с помощью программы infoalign из EMBOSS была получена
Таблица 2, из которой следует, что эти гены различаются на 0.95%.
Полногеномные исследования показывают (Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome.
Nature, 437(7055), 69–87. doi:10.1038/nature04072), что по всему геному процент различий равен примерно 1.23%. Так что для гена важного белка
у MAO-A вполне ожидаемый процент различий.
Таблица 2.
Информация о выравнивании генов MAOA человека и шимпанзе.