| Uniprot ID | Q9UWP7_9EURY |
| Uniprot AC | Q9UWP7; Q7LWZ3; |
| Refseq ID | - |
| PDB ID | 1NNQ; 2HR5; 3MPS; 3PWF; 3PZA; 3QVD; |
| Длина (в аминокислотных остатках) | 171 |
| Молекулярная масса, Да | 19501 |
| Рекомендуемое Uniprot название | Rubrerythrin |
Таблица 1. Основные данные о белке Rubrerythrin (PDB ID: 3MPS)
Белок представлен 8 цепями.Структура известна для всего белка.
| Кластер | UniRef100 | UniRef90 | UniRef50 |
| Описание кластера | Содержит идентичные последовательности и фрагменты с 11 и более остатками | Содержит последовательности из UniRef100, которые по крайней мере на 90 % идентичны и на 80% перекрываются с самой длинной последовательностью в кластере | Содержит самые длинные последовательности из UniRef90, которые по крайей мере идетичны на 50% и на 80% перекрыаются с самой длинной посдледовательностью в кластере |
| Идентификатор кластера | UniRef100_I6U7U3 | UniRef90_I6U7U3 | UniRef50_Q97ET8 |
| Количество белков в кластере | 3 | 3 | 164 |
Таблица 2. Кластеры белка Rubrerythrin (PDB ID: 3MPS)
| Вид поиска | >Текст запроса | Количество найденных белков | Reviewed |
| По рекомендованному названию | name:rubrerythrin | 4721 | 8 |
| По тому же названию среди белков из организмов того же семейства | name:rubrerythrin taxonomy:"Thermococcaceae [2259]" | 114 | 0 |
| По тому же названию среди белков из организмов того же отдела | name:rubrerythrin taxonomy:"Euryarchaeota [28890]" | 509 | 1 |
| По названию гемоглобин (hemoglobin) без ограничения на организмы | name:hemoglobin | 8374 | 944 |
| По названию гемоглобин (hemoglobin) среди членистоногих (Arthropoda) | name:hemoglobin taxonomy:"Arthropoda [6656]" | 745 | 0 |
| По названию гемоглобин (hemoglobin) среди животных (Metazoa) | name:hemoglobin taxonomy:"Metazoa [33208]" | 3357 | 838 |
| По названию "трипсин" (trypsin) | name:trypsin | 11159 | 301 |
| По названию "трипсин" (trypsin), исключающий ингибиторы трипсина | name:trypsin NOT annotation:(type:function inhibitor) | 11089 | 231 |
Первая запись была добавлена 1 мая 2000 года, последняя — 16 марта 2016. Всего за это время запись модифицировалась 103 раза. Наибольшее число изменений пришлось на 2006 год — их было 12.
Дисульфидные связи, как и многие другие интересные явления (посттрансляционная модификация, альтернативный сплайсинг) можно обнаружить в графе PTM/processing. Здесь содержится информация о позициях остатков цистеина, участвующих в образовании дисульфидных связей. Кроме того, в этой графе указывается, внутрицепочечная иди межцепочечная эта связь, является ли она окислительно восстановительным центром, определена точно или предсказана.
Примеры:
Внутрицепочечная дисудьфидная связь: Protein 108, Solanum lycopersicum (Q43495)
Межцепочечная дисульфидная связь: Snaclec botrocetin subunit beta, Bothrops jararaca (P22030)
Некоторые дисульфидные связи представляют собой окислительно-восстановительные центры, участвуя в обратимом окислении остатка цистеина до цистеиновой кислоты. Например: ERO1-like protein alpha, Homo sapiens (Q96HE7)
Предсказанные дисульфидные связи ( на основании выравнивания отдельных последовательностей с последовательностями доменов, содержащих дисульфидную связь): Basigin, Bos taurus(Q865R3)
© Васильева Елена, 2015