Четвертый семестр

Практикумы 1-3 — Построение филогенетического древа при помощи iTOL и филогенетическая реконструкция методами PhyML, TNT и FastME в программе NGPhylogeny.fr.

Практикум 4 — Реконструкция филогении организмов по белку CLPX_ECOLI при помощи FastME, идентификация ортологов и паралогов.

Практикум 6 — Предсказание трансмембранных доменов белка множествественной лекарственной устойчивости и мембраноатакующего комплекса при помощи DeepTMHMM и PPM 3.0 в сочетании с AlphaFold.

Практикум 7 — Изучение баз данных Reactome, Human Protein Atlas и Human String.

Практикум 8 — Сигналы в геноме, примеры и поиск сигналов с известными последовательностями.

Практикум 9 — Поиск de novo сигналов в ДНК при помощи программ Operon-mapper, MEME и FIMO.

Практикум 10 — Мотивы в белках и PSI-BLAST.

Практикум 11 — Домены и профили.