Четвертый семестр (весна 2008)
Круг задач расширяется:
от изучения отдельных последовательностей и структур переходим к изучению
подходов и ресурсов, предназначенных для филогенетической
реконструкции,
функциональной аннотации, к изучению конкретного белкового семейства.
|
| |
Блок 1. Эволюция последовательностей |
| |
1. |
Биоинформатика в
современной теории эволюции (лекция+семинар)
12 февраля 2008 г.; А.Б.Рахманинова, А.В.Головин
[презентация]
[упражнения]
|
| |
2. |
Моделирование и реконструкция эволюции гена
19 февраля 2008 г.; А.Б.Рахманинова, А.В.Головин
[задания]
[подсказки]
|
| |
3. |
Филогенетические деревья, продолжение...
26 февраля 2008 г.; А.Б.Рахманинова
[задания]
|
| |
4. |
Алгоритмы реконструкции филогенетических деревьев
(лекция+семинар, тест)
4 марта, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин
[презентация]
|
| |
5. |
Самостоятельная работа "Построение и анализ филогенетического дерева"
11 марта, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин
[задания]
|
| |
Объявление: |
после завершения самостоятельной работы можно будет сдать долги
по первому блоку, например, переписать тесты.
|
| |
|
Правила получения зачета за первый блок
|
| |
Блок 2. Функции |
| |
6. |
|
| |
7. |
|
| |
8. |
|
| |
9. |
|
| |
| |
|
| |
| |
Блок 3. Эволюция семейства белков |
| |
10. |
Эволюционные домены белков
15 апреля, С.А.Спирин
[презентация]
[задания]
|
| |
11. |
Банк Prosite. Паттерны и профили
22 апреля, С.А.Спирин
[задания]
[указания]
|
|
12. |
Выравнивание последовательностей белков на основе их пространственной структуры
6 мая, С.А.Спирин
[задания]
|
