Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2007

Cеместры Студенты Преподаватели
 
 
На главную страницу
 
  2006
  2005
  2004
  2003
2002

Cеместр IV. Последовательности: эволюция и функция

Круг задач расширяется: от изучения отдельных последовательностей и структур переходим к изучению подходов и ресурсов, предназначенных для филогенетической реконструкции, функциональной аннотации, к изучению конкретного белкового семейства.
 

Блок 1: эволюция последовательностей или введение в молекулярную филогенетику

1.

Молекулярная эволюция, построение модели (лекция+практикум)

10 февраля, Е.А.Аксянов, А.В.Алексеевский
[презентация] 
[упражнения] [материалы к упражнениям]
[задания к отчету]
[дополнительная литература]

2.

Эволюционная модель и эволюционные расстояния (лекция+семинар+тест)

17 февраля, Е.А.Аксянов, А.В.Алексеевский
[вопросы теста]

3.

Алгоритмы построения филогенетических деревьев (лекция+тест)

24 февраля, Е.А.Аксянов, А.В.Алексеевский
[вопросы теста]

Правила получения зачета за первый блок.

Блок 2: функции или проблемы функциональной аннотации

6.

Функции. Онтологии базы данных GO.

24 марта, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин
[презентация] [задания] [дополнительные задания] [варианты]

7.

Функции. Классификация. Коды ферментов.

31 марта, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин
[презентация] [задания] [дополнительные задания] [варианты]

8.

Метаболические пути. KEGG.

7 апреля, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин
[презентация] [статья о KEGG] [задания] [варианты]

9.

Предсказание трансмембранных белков.

14 апреля, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин
[презентация] [задания] [варианты] [подсказки]
[правила получения зачета за 2 блок]
[результаты по состоянию на 29 мая 2009 (в xls)]

Блок 3: эволюция семейства белков

10.

Эволюционные домены белков.
Проект "Эволюция белков михондриальных рибосом"

22 апреля, А.В.Головин, А.Б.Рахманинова
[презентация] [задания] [подсказки]

11.

Продолжение работы над проектом....

5 мая, А.В.Головин, А.Б.Рахманинова

12.

Завершение работы над проектом

12 мая, А.В.Головин, А.Б.Рахманинова
Правила получения зачета за третий блок

Семинары по молекулярной биологии