Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2009

Cеместры Студенты Преподаватели
 
 
На главную страницу
 
  2008
  2007
  2006
  2005
2004
2003
2002

Cеместр I. Объекты и инструменты

Каждый студент получает имя гена и создает описание свойств соответствующего белка. Все имена разные. В процессе создания описания студенты учатся работать с широко известными программами FAR manager, Word, Excel, Internet Explorer, Outlook Express, а также с профессиональными программами — ACD/ChemSketch и RasMol. Cтуденты изучают язык HTML и оформляют отчет о проделанной работе в виде персонального учебного web-сайта.

Персональные данные для каждого студента: белок Bacillus subtilis (идентификаторы последовательности), пространственная структура белка (PDB-код),

Блок 1: FAR Manager. Internet. HTML.

1.

Что такое биоинформатика?
4 и 7 сент., А.Б.Рахманинова
[презентация]

2.

FAR Manager

11 и 14 сент., А.Б.Рахманинова, Д.А.Равчеев

[задания]   [инструкция по FAR]   [примеры заданий по FAR]

3.

Интернет
18 и 21 сент., А.Б.Рахманинова, Д.А.Равчеев

[задания]

4.

Поисковые системы в сети интернет
25 и 28 сент., Д.А.Равчеев, А.Б.Рахманинова

[задания]   [подсказки]   [варианты заданий]

5.

HTML
9 и 5 окт., А.Б.Рахманинова

[задания]   [краткий учебник по HTML, полезные ссылки]   [спецсимволы]

6.

Зачетное занятие: создаем учебный сайт.
9 и 12 окт., А.Б.Рахманинова, Д.А.Равчеев

[задания]   [результаты проверки (гр.102)]

Правила получения зачета за первый блок

Блок 2: MS Excel.

7.

MS Excel. Анализ состава белка.

16 и 19 окт., А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев
[презентация]   [задания]   [формулы аминокислот]

8.

MS Excel. Свойства аминокислот.

23 и 26 окт., А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев
[задания]   [подсказки]   [свойства аминокислот]

9.

MS Excel. Зачетное занятие.

30 окт. и 2 нояб., А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев
[зачетные задания для группы 102 ]   [формат отчета за блок]
[зачетные задания для группы 101]
[еще одно дополнительное задание...]

Правила получения зачета за второй блок

Блок 3: Пространственные структуры молекул.

10.

ACD ChemSketch.

6 и 9 нояб., А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев
[презентация]   [задания]   [подсказки]

11.

RasMol

13 и 16 нояб., А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев
[задания]   [подсказки]   [краткий учебник по RasMol]   [презентация]

12.

Карта Рамачандрана

20 и 23 нояб., Д.А. Равчеев, А.Б.Рахманинова
[задания]   [подсказки]  

13.

Вторичная структура

27 и 30 нояб., А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев
[задания]   [подсказки]   [презентация]  

14.

Контакты в молекуле белка

4 и 7 декабря, А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев
[задания]   [подсказки]  

15.

Зачетное занятие по работе с RasMol

11 и 14 декабря, А.Б.Рахманинова, Д.А. Равчеев

Правила получения зачета за третий блок