Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2017
Последовательности и структуры нуклеиновых кислот
Результаты Только для студентов и преподавателей
Записаться в очередь на проверку
Новости
Блок 1: Пространственные структуры нуклеиновых кислот
1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)
4 сентября 2018, А.В. Головин
[ презентация ]
2. Мини-контрольная. Химическое строение нуклеиновых кислот
11 сентября 2018, А.В. Головин
3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК
18 сентября 2018, А.В. Головин.
4. Комплексы ДНК-белок
25 сентября 2018, А.В. Головин.
Блок 2: Последовательности нуклеиновых кислот
При записи в очередь нумеруйте практикумы этого блока в соответствии с нумерацией занятий (т.е. 6, 7, 8 ...)
6. Прочтение последовательностей по Сэнгеру
9 октября 2018, С.А.Спирин, Е. Очередько
[ презентация ] [ задания ]
7. Нуклеотидные банки данных
16 октября 2018, С.А.Спирин
[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]
8. Поиск по сходству (нуклеотидный blast)
23 октября 2018, С.А.Спирин
[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]
9. EMBOSS и локальный BLAST
30 октября 2018, С.А.Спирин
10. Геномные браузеры
6 ноября 2018, С.А.Спирин
[ задания ]
Блок 3. Сборка и анализ геномов
11. Ресеквенирование. Поиск полиморфизмов у человека.
13 ноября 2018, А.Жарикова
[ презентация ] [задания]
12. Анализ транскриптомов
20 ноября 2018, А.Жарикова
[ презентация ] [задания]
13. Bedtools
27 ноября 2018, А.Жарикова
[ презентация ] [задания]
За задания 11-13 мягкий дедлайн - 5го декабря 2018 в 23:59, жесткий дедлайн с большими штрафами - 11 декабря в 23:59.
14. Сборка de novo
4 декабря 2018, М.Хачатурян
При записи в очередь информации о выполнении 14-го практикума следует выбирать вариант "резерв". Приносим свои извинения за техническую накладку.
Консультация. Лекция по сборке небольших геномов
11 декабря 2018, все
Коллоквиум
18 декабря 2018, все
Зачёт
25 декабря 2018 (вероятнее всего, но дата может поменяться!)
10 окт.
17го октября состоится мини-кр. В неё включены темы:
Немного истории по изобретению ПЦР, секвенирования по Сангеру (автор, годы - примерно)
ПЦР – что в пробирке на входе, продукт ПЦР
Секвенирование по Сангеру - что в пробирке на входе, результат секвенирования, источники разного типа подозрительных мест в хроматогрмме
Подготовка: презентация и ссылки из нее, др. курсы, интернет
Успехов!
ААл
Коллеги студенты и преподаватели!
Я создал форму для сообщений о выполнении зданий практикумов и google doc для хранения этих сообщений и результатов проверки. Если возникнут проблемы - пишите мне.
Важно. Дата получения сообщения о выполении заданий практикума автоматически включается в ведомость и считается датой сдачи работы. Преподаватель устанавливает два deadline'а: без потери баллов за опоздание, ориентировочно, неделя или чуть больше; и жесткий deadine: если работа сдана между мягким и жестким deadline'ами то штрафуется незначительно, 0.5 балла; если после жесткого, то проверяется только в зачетную сессию и штрафуется 2 баллами (обычно, практикум оценивается из 5-и баллов). Deadline'ы проставляет преподаватель в строках 2 и 3 колонки "штраф за опоздание", сам штраф вычисляется автоматически.
ААл