Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2020

Семестр 2. Структуры и последовательности белков

Расписание

Результаты Только для студентов и преподавателей

Записаться в очередь на проверку

Состояние очереди

Здесь вы можете задать вопрос преподавателям по курсу 2го семестра

Здесь можно увидеть ответы на вопросы

Объявления

26 мая

Досдачи коллоквиума и контрольной по структурной части 26.05.2021. 1 группа в 13:00, 2 группа в 16:00. Пожалуйста, подготовьтесь перед тем, как идти сдавать!

Общий сбор в fbb.lv/207

— АЗло

18 мая

Коллеги, решил, что "переписывание" контрольных по блоку 3 буду принимать устно в BBB. Прошу желающих группироваться и договариваться со мной о конкретном времени через телеграм или почту. По первой контрольной надо будет ответить на теоретические вопросы, а по второй – продемонстрировать умения. Готовьтесь заранее, много времени на раздумья давать не буду.

— ИР

12 мая

Проверил все по практикумам 1-4, поставленное в очередь после коллоквиума. Если вы что-то сделали или исправили, и оно еще не проверено, убедитесь, что ставили это в очередь. Если нет, то, пожалуйста, поставьте.

— АЗло

28 апреля

Проверил кр10. Ослабил условие для её зачета, но выложил пример решения. Прошу ознакомиться даже тех, кто получил зачет за контрольную. Доступ к заданиям тоже открыл. Задания на переписывании будут отличаться.

— ИР

14 апреля

В начале следующего занятия будет контрольная по материалам практикумов пр.8 и пр.9.

И все-таки поменял отчетность за пр.9, обратите внимание.

— ИР

10 апреля

Бегло проглядел первый присланный отчет по пр.8. Хочу сразу прокомментировать, чтобы потом меньше вопросов было. Комментарии здесь.

— ИР

Блок 1. HTML, CSS, основы веб-дизайна

1. Введение в HTML, основы CSS

9 февраля, В. Маслова, А. Злобин

[ презентация ] [ текст "практикума" ] [ задания ]

2. CSS, Bootstrap

16 февраля, В. Маслова, А. Злобин

[ презентация ] [ задания ]

Блок 2. 3D структуры белков

3. Структура белка. Jmol

2 марта, А. Злобин, В. Маслова

[ презентация ] [ презентация Залевского 2020 ] [ задания ] [ подсказки ] [ видеогайд по J(S)Mol ] [ описание J(S)Mol ] [ Jmol faq ]

4. Атлас контактов

9 марта, А. Злобин

[ презентация ] [ задание ]

5. Разнообразие белков

16 марта, А. Злобин

[ презентация ]

6. Лиганды/малые молекулы

23 марта, А. Злобин

[ презентация ]

7. Коллоквиум

30 марта, А. Залевский, А. Злобин, В. Маслова

[ вопросы ] [ запись для сдачи ]

Блок 3. Банки белковых последовательностей

8. UniProt

6 апреля, И. Русинов, А.В. Алексеевский

[ презентация ] [ задания ] [ комментарии ]

9. EMBOSS, bash

13 апреля, И. Русинов

[ презентация (EMBOSS) ] [ задания ]

10. Протеомы и кластеры UniProt

20 апреля, И. Русинов

[ презентация ] [ задания ] [ контрольная ] [ решение ]

Блок 4. Выравнивание последовательностей

11. Выравнивание как отражение эволюции. Программы парного выравнивания. Jalview.

27 апреля, С.А. Спирин, И. Русинов

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]

12. Дополнительная лекция: алгоритмы выравнивания

4 мая только в 15:35 онлайн, С.А. Спирин

[ презентация ] [ видеозапись ]

13. Программа BLAST

11 мая, С.А. Спирин, И. Русинов

[ презентация ] [ задания ] [ подсказки ]

14. Множественное выравнивание, эволюционные домены белков

18 мая, А.В. Алексеевский

[ презентация ] [ задание в классе ]

15. Коллоквиум по блокам 3 и 4

25 мая, все

[ программа ]